Protein–RNA interactions for Protein: P50637

Tspo, Translocator protein, mousemouse

Predictions only

Length 169 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TspoP50637 Gm44030-201ENSMUST00000204865 432 ntBASIC2.53□□□□□ -2
TspoP50637 Gm45588-201ENSMUST00000211213 630 ntBASIC2.53□□□□□ -2
TspoP50637 Gm8681-201ENSMUST00000219115 618 ntBASIC2.53□□□□□ -2
TspoP50637 Gm33981-201ENSMUST00000219918 660 ntTSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2
TspoP50637 AC160114.1-201ENSMUST00000221930 365 ntBASIC2.53□□□□□ -2
TspoP50637 Gm31025-201ENSMUST00000222553 482 ntTSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2
TspoP50637 AC154692.1-201ENSMUST00000228314 544 ntBASIC2.53□□□□□ -2
TspoP50637 Vmn1r35-201ENSMUST00000071414 891 ntAPPRIS P1 BASIC2.53□□□□□ -2
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TspoP50637 Gm14656-201ENSMUST00000120342 502 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
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TspoP50637 4930555B12Rik-201ENSMUST00000135444 283 ntTSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
TspoP50637 1700046C09Rik-201ENSMUST00000139973 543 ntTSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
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TspoP50637 Gm8926-202ENSMUST00000178158 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.52□□□□□ -2.01
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TspoP50637 Gm8922-202ENSMUST00000178989 465 ntTSL 5 BASIC2.52□□□□□ -2.01
TspoP50637 Speer1-202ENSMUST00000179482 465 ntTSL 5 BASIC2.52□□□□□ -2.01
TspoP50637 2310010J17Rik-201ENSMUST00000181189 490 ntTSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
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TspoP50637 Gm20835-201ENSMUST00000185565 923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.52□□□□□ -2.01
TspoP50637 Gm29564-201ENSMUST00000185575 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
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TspoP50637 Gm21095-202ENSMUST00000185776 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
TspoP50637 Gm28553-201ENSMUST00000185924 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
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TspoP50637 Gm28827-201ENSMUST00000187165 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
TspoP50637 Gm20931-202ENSMUST00000187293 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
TspoP50637 Gm21760-202ENSMUST00000187433 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
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TspoP50637 Gm20869-201ENSMUST00000188958 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
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TspoP50637 Gm21258-202ENSMUST00000191553 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
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TspoP50637 Crs-ps-201ENSMUST00000203723 760 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
TspoP50637 Gm19126-201ENSMUST00000207896 509 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
TspoP50637 A530021J07Rik-203ENSMUST00000208111 308 ntTSL 2 BASIC2.52□□□□□ -2.01
TspoP50637 E330011O21Rik-203ENSMUST00000210555 455 ntTSL 5 BASIC2.52□□□□□ -2.01
TspoP50637 Gm9712-201ENSMUST00000210842 311 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
TspoP50637 Scoc-204ENSMUST00000212449 280 ntTSL 3 BASIC2.52□□□□□ -2.01
TspoP50637 AC093926.1-201ENSMUST00000213730 243 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
TspoP50637 Olfr966-ps1-201ENSMUST00000214875 577 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
TspoP50637 AC152979.4-201ENSMUST00000219893 379 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
TspoP50637 Gm30738-201ENSMUST00000221346 502 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
TspoP50637 Mir21a-201ENSMUST00000083521 92 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
TspoP50637 Mir346-201ENSMUST00000083547 98 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
TspoP50637 Olfr811-202ENSMUST00000215058 2508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.52□□□□□ -2.01
TspoP50637 Mctp1-202ENSMUST00000109589 1653 ntTSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
TspoP50637 C87977-201ENSMUST00000105753 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
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