Protein–RNA interactions for Protein: P41105

Rpl28, 60S ribosomal protein L28, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 137 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl28P41105 Gm17872-201ENSMUST00000222550 532 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
Rpl28P41105 AC154224.1-201ENSMUST00000224367 403 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
Rpl28P41105 AC174797.3-202ENSMUST00000224578 587 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
Rpl28P41105 AC126275.1-201ENSMUST00000224881 446 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
Rpl28P41105 AC102603.1-201ENSMUST00000227481 584 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
Rpl28P41105 Lelp1-201ENSMUST00000029535 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.98□□□□□ -2.09
Rpl28P41105 Gm9845-201ENSMUST00000056409 598 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
Rpl28P41105 Vmn1r12-201ENSMUST00000073384 924 ntAPPRIS P2 BASIC1.98□□□□□ -2.09
Rpl28P41105 Olfr776-201ENSMUST00000073704 939 ntAPPRIS P1 BASIC1.98□□□□□ -2.09
Rpl28P41105 Gm22979-201ENSMUST00000082609 159 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
Rpl28P41105 Gm23847-201ENSMUST00000083829 110 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
Rpl28P41105 Rpl26-ps2-201ENSMUST00000085379 435 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
Rpl28P41105 Olfr970-202ENSMUST00000213975 1630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.98□□□□□ -2.09
Rpl28P41105 Gm4211-201ENSMUST00000181103 2220 ntTSL 1 (best) BASIC1.98□□□□□ -2.09
Rpl28P41105 Mmp12-201ENSMUST00000005950 3607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.98□□□□□ -2.09
Rpl28P41105 Stap1-206ENSMUST00000198435 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.98□□□□□ -2.09
Rpl28P41105 Olfr811-202ENSMUST00000215058 2508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.97□□□□□ -2.09
Rpl28P41105 Rgs1-208ENSMUST00000189061 3841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.97□□□□□ -2.09
Rpl28P41105 Olfr594-202ENSMUST00000214051 2809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.97□□□□□ -2.09
Rpl28P41105 Gm38706-201ENSMUST00000182397 2617 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
Rpl28P41105 Gm43016-201ENSMUST00000196628 3150 ntTSL 1 (best) BASIC1.97□□□□□ -2.09
Rpl28P41105 Gm14322-201ENSMUST00000108942 1074 ntTSL 2 BASIC1.97□□□□□ -2.09
Rpl28P41105 Gm14448-201ENSMUST00000116383 210 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
Rpl28P41105 Gm15282-201ENSMUST00000117707 300 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
Rpl28P41105 Gm6274-201ENSMUST00000118173 797 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
Rpl28P41105 Gm11356-201ENSMUST00000118974 192 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
Rpl28P41105 Gm14322-202ENSMUST00000119838 1077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.97□□□□□ -2.09
Rpl28P41105 Gm14534-201ENSMUST00000120045 357 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
Rpl28P41105 Gm12042-201ENSMUST00000120479 301 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
Rpl28P41105 Gm13210-201ENSMUST00000121483 273 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
Rpl28P41105 Defa-ps5-201ENSMUST00000121541 279 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
Rpl28P41105 Gm15065-201ENSMUST00000121699 273 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
Rpl28P41105 Gm14418-202ENSMUST00000128657 1077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.97□□□□□ -2.09
Rpl28P41105 Gm16533-201ENSMUST00000140035 228 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
Rpl28P41105 Gm15397-201ENSMUST00000145790 804 ntTSL 3 BASIC1.97□□□□□ -2.09
Rpl28P41105 Gm15875-201ENSMUST00000152264 273 ntTSL 3 BASIC1.97□□□□□ -2.09
Rpl28P41105 Gm12976-202ENSMUST00000153817 412 ntTSL 3 BASIC1.97□□□□□ -2.09
Rpl28P41105 Gm24905-201ENSMUST00000158129 104 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
Rpl28P41105 Gm23409-201ENSMUST00000158516 237 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
Rpl28P41105 Gm23205-201ENSMUST00000158671 103 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
Rpl28P41105 Gm23028-201ENSMUST00000158773 265 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
Rpl28P41105 Tshb-202ENSMUST00000170856 552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.97□□□□□ -2.09
Rpl28P41105 Gm25412-201ENSMUST00000180258 107 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
Rpl28P41105 Gm27330-201ENSMUST00000184689 132 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
Rpl28P41105 Snhg14-203ENSMUST00000185815 670 ntTSL 5 BASIC1.97□□□□□ -2.09
Rpl28P41105 Gm29104-201ENSMUST00000186304 222 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
Rpl28P41105 1700109G14Rik-203ENSMUST00000190737 801 ntTSL 1 (best) BASIC1.97□□□□□ -2.09
Rpl28P41105 Fasl-202ENSMUST00000193648 406 ntTSL 1 (best) BASIC1.97□□□□□ -2.09
Rpl28P41105 Gm18340-201ENSMUST00000196342 609 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
Rpl28P41105 Csn1s2a-203ENSMUST00000196749 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.97□□□□□ -2.09
Rpl28P41105 Gm44839-201ENSMUST00000206590 241 ntTSL 5 BASIC1.97□□□□□ -2.09
Rpl28P41105 Olfr468-ps1-201ENSMUST00000207203 593 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
Rpl28P41105 AC171203.1-201ENSMUST00000215363 456 ntTSL 5 BASIC1.97□□□□□ -2.09
Rpl28P41105 4930401A07Rik-202ENSMUST00000216155 360 ntTSL 2 BASIC1.97□□□□□ -2.09
Rpl28P41105 Gm18892-201ENSMUST00000217628 881 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
Rpl28P41105 Trdn-207ENSMUST00000219931 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.97□□□□□ -2.09
Rpl28P41105 AC126275.2-201ENSMUST00000225224 253 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
Rpl28P41105 Snora23-201ENSMUST00000082517 184 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
Rpl28P41105 n-R5s85-201ENSMUST00000083453 113 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
Rpl28P41105 Olfr1289-201ENSMUST00000120021 1643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.97□□□□□ -2.09
Rpl28P41105 Gm19965-201ENSMUST00000179777 3030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.97□□□□□ -2.09
Rpl28P41105 Btbd35f3-201ENSMUST00000140300 1943 ntAPPRIS P1 BASIC1.97□□□□□ -2.09
Rpl28P41105 Olfr597-202ENSMUST00000216456 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.97□□□□□ -2.09
Rpl28P41105 Gm37387-201ENSMUST00000192201 1806 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
Rpl28P41105 AC154552.6-201ENSMUST00000221365 1342 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
Rpl28P41105 Trav8d-2-201ENSMUST00000103605 334 ntAPPRIS ALT2 BASIC1.96□□□□□ -2.1
Rpl28P41105 Gm25764-201ENSMUST00000104092 134 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
Rpl28P41105 Gm22590-201ENSMUST00000104247 128 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
Rpl28P41105 Vmn1r127-201ENSMUST00000105199 918 ntAPPRIS P1 BASIC1.96□□□□□ -2.1
Rpl28P41105 Gm12509-201ENSMUST00000118033 609 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
Rpl28P41105 Gm15126-201ENSMUST00000118631 833 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
Rpl28P41105 Rpl36a-ps3-201ENSMUST00000120093 321 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
Rpl28P41105 Gm15037-201ENSMUST00000120358 259 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
Rpl28P41105 Gm16445-201ENSMUST00000120399 714 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
Rpl28P41105 Vmn1r-ps102-201ENSMUST00000120663 886 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
Rpl28P41105 Gm12723-201ENSMUST00000120700 451 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
Rpl28P41105 Gm11414-201ENSMUST00000121795 263 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
Rpl28P41105 1700119I11Rik-201ENSMUST00000122270 336 ntTSL 1 (best) BASIC1.96□□□□□ -2.1
Rpl28P41105 Gm12958-201ENSMUST00000141242 674 ntTSL 3 BASIC1.96□□□□□ -2.1
Rpl28P41105 1700073E17Rik-202ENSMUST00000146858 382 ntTSL 1 (best) BASIC1.96□□□□□ -2.1
Rpl28P41105 1700013N06Rik-201ENSMUST00000156376 663 ntTSL 5 BASIC1.96□□□□□ -2.1
Rpl28P41105 Gm23667-201ENSMUST00000157466 120 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
Rpl28P41105 Gm26088-201ENSMUST00000157896 131 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
Rpl28P41105 Gm24730-201ENSMUST00000158228 117 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
Rpl28P41105 Gm25902-201ENSMUST00000158493 318 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
Rpl28P41105 Gm25977-201ENSMUST00000158697 85 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
Rpl28P41105 Adgrg4-206ENSMUST00000168724 531 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
Rpl28P41105 Vmn1r88-201ENSMUST00000171783 951 ntAPPRIS P1 BASIC1.96□□□□□ -2.1
Rpl28P41105 Obox2-202ENSMUST00000172478 818 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.96□□□□□ -2.1
Rpl28P41105 Gm22853-201ENSMUST00000174974 131 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
Rpl28P41105 Mir3473c-201ENSMUST00000175262 81 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
Rpl28P41105 Obox4-ps6-201ENSMUST00000176578 724 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
Rpl28P41105 Gm20672-201ENSMUST00000176605 261 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
Rpl28P41105 Prl3c1-203ENSMUST00000178072 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.96□□□□□ -2.1
Rpl28P41105 Gm8926-202ENSMUST00000178158 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.96□□□□□ -2.1
Rpl28P41105 Gm8879-202ENSMUST00000178863 465 ntTSL 5 BASIC1.96□□□□□ -2.1
Rpl28P41105 Gm8922-202ENSMUST00000178989 465 ntTSL 5 BASIC1.96□□□□□ -2.1
Rpl28P41105 Speer1-202ENSMUST00000179482 465 ntTSL 5 BASIC1.96□□□□□ -2.1
Rpl28P41105 Gm25942-201ENSMUST00000180080 110 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
Rpl28P41105 Gm28591-201ENSMUST00000185259 183 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
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