Protein–RNA interactions for Protein: P17919

Hoxb1, Homeobox protein Hox-B1, mousemouse

Predictions only

Length 297 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb1P17919 AC133910.1-201ENSMUST00000228128 624 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
Hoxb1P17919 Defb9-201ENSMUST00000057076 310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
Hoxb1P17919 Gm6065-201ENSMUST00000081336 492 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
Hoxb1P17919 Vmn1r171-209ENSMUST00000228228 2863 ntAPPRIS ALT2 BASIC4.84□□□□□ -1.63
Hoxb1P17919 Gm14014-201ENSMUST00000156718 2717 ntTSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
Hoxb1P17919 Vmn2r80-201ENSMUST00000165834 2690 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
Hoxb1P17919 Vmn1r67-202ENSMUST00000226237 2352 ntAPPRIS ALT2 BASIC4.84□□□□□ -1.64
Hoxb1P17919 Ktn1-209ENSMUST00000187262 3913 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.64
Hoxb1P17919 Olfr129-202ENSMUST00000216476 5275 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.84□□□□□ -1.64
Hoxb1P17919 Gm44027-201ENSMUST00000203419 3480 ntBASIC4.84□□□□□ -1.64
Hoxb1P17919 Olfr1270-205ENSMUST00000216354 4836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.64
Hoxb1P17919 Gm42986-201ENSMUST00000201618 3385 ntBASIC4.84□□□□□ -1.64
Hoxb1P17919 Gm19666-201ENSMUST00000198176 1893 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
Hoxb1P17919 Pon3-201ENSMUST00000031773 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
Hoxb1P17919 Tfpi-205ENSMUST00000111717 2962 ntTSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
Hoxb1P17919 Gm16041-201ENSMUST00000144339 3725 ntTSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
Hoxb1P17919 Gm37101-201ENSMUST00000191656 3660 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
Hoxb1P17919 Zzz3-201ENSMUST00000089982 4197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
Hoxb1P17919 Slfn4-201ENSMUST00000000208 3958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
Hoxb1P17919 Gm15581-201ENSMUST00000131334 5640 ntTSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
Hoxb1P17919 Gm37393-201ENSMUST00000195118 3870 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
Hoxb1P17919 Igkv1-131-201ENSMUST00000103306 362 ntAPPRIS P1 BASIC4.83□□□□□ -1.64
Hoxb1P17919 Tmco2-201ENSMUST00000106268 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
Hoxb1P17919 Gm12112-201ENSMUST00000117772 231 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
Hoxb1P17919 n-R5s192-201ENSMUST00000122577 119 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
Hoxb1P17919 3110004A20Rik-201ENSMUST00000123904 385 ntTSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
Hoxb1P17919 Gm15537-201ENSMUST00000126677 485 ntTSL 2 BASIC4.83□□□□□ -1.64
Hoxb1P17919 Gm16086-201ENSMUST00000143652 371 ntTSL 3 BASIC4.83□□□□□ -1.64
Hoxb1P17919 Gm14041-201ENSMUST00000150181 276 ntTSL 3 BASIC4.83□□□□□ -1.64
Hoxb1P17919 Gm23662-201ENSMUST00000158046 111 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
Hoxb1P17919 Gm23408-201ENSMUST00000158523 265 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
Hoxb1P17919 Gm25486-201ENSMUST00000158726 63 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
Hoxb1P17919 Gm25445-201ENSMUST00000158996 299 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
Hoxb1P17919 Gm24957-201ENSMUST00000179604 132 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
Hoxb1P17919 Gm27849-201ENSMUST00000183673 125 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
Hoxb1P17919 Gm27624-201ENSMUST00000185047 177 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
Hoxb1P17919 Gm28353-201ENSMUST00000186482 570 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
Hoxb1P17919 Gm28533-201ENSMUST00000186741 570 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
Hoxb1P17919 Gm28075-201ENSMUST00000189179 354 ntTSL 3 BASIC4.83□□□□□ -1.64
Hoxb1P17919 Gm38131-201ENSMUST00000192449 430 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
Hoxb1P17919 Mir6906-201ENSMUST00000198998 58 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
Hoxb1P17919 AC158798.1-201ENSMUST00000219714 711 ntTSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
Hoxb1P17919 AC113031.3-201ENSMUST00000226552 190 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
Hoxb1P17919 AC124709.3-201ENSMUST00000227294 171 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
Hoxb1P17919 C130073F10Rik-201ENSMUST00000051043 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
Hoxb1P17919 BC051076-202ENSMUST00000199477 2868 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
Hoxb1P17919 Senp8-202ENSMUST00000163586 3570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
Hoxb1P17919 Gm13912-201ENSMUST00000156541 1860 ntTSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
Hoxb1P17919 AC154227.1-201ENSMUST00000228809 2467 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
Hoxb1P17919 Psg25-201ENSMUST00000094795 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
Hoxb1P17919 Ckap5-201ENSMUST00000046769 6511 ntTSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
Hoxb1P17919 Ncoa7-203ENSMUST00000213836 2989 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
Hoxb1P17919 Olfr1289-201ENSMUST00000120021 1643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
Hoxb1P17919 Gm6162-201ENSMUST00000194870 2930 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
Hoxb1P17919 AC116797.2-201ENSMUST00000224763 4221 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
Hoxb1P17919 March1-205ENSMUST00000110255 4177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
Hoxb1P17919 Gm43359-201ENSMUST00000197944 2200 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
Hoxb1P17919 Gnal-202ENSMUST00000076605 5223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
Hoxb1P17919 Olfr1226-206ENSMUST00000217601 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
Hoxb1P17919 Vmn2r99-201ENSMUST00000176107 2571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
Hoxb1P17919 Gm29325-201ENSMUST00000190705 2528 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
Hoxb1P17919 Olfr365-202ENSMUST00000213969 5333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
Hoxb1P17919 Elavl4-203ENSMUST00000106597 4149 ntTSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
Hoxb1P17919 Tex47-203ENSMUST00000160634 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
Hoxb1P17919 Akap4-201ENSMUST00000057101 2851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
Hoxb1P17919 Gm5347-201ENSMUST00000210542 2327 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
Hoxb1P17919 Pdc-202ENSMUST00000185698 3335 ntTSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
Hoxb1P17919 Mir690-201ENSMUST00000102110 109 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
Hoxb1P17919 Gm25875-201ENSMUST00000104323 107 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
Hoxb1P17919 Mir466j-201ENSMUST00000116876 122 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
Hoxb1P17919 Gm23990-201ENSMUST00000117031 117 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
Hoxb1P17919 Gm11826-201ENSMUST00000118781 438 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
Hoxb1P17919 Gm22026-201ENSMUST00000122735 281 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
Hoxb1P17919 Gm15687-201ENSMUST00000141440 269 ntTSL 3 BASIC4.82□□□□□ -1.64
Hoxb1P17919 Platr32-201ENSMUST00000148597 394 ntTSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
Hoxb1P17919 Gm25834-201ENSMUST00000158916 101 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
Hoxb1P17919 Mir3058-201ENSMUST00000175126 91 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
Hoxb1P17919 Naa60-210ENSMUST00000176224 501 ntTSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
Hoxb1P17919 Gm27285-201ENSMUST00000183875 127 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
Hoxb1P17919 Gm27781-201ENSMUST00000185185 92 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
Hoxb1P17919 Gm29926-201ENSMUST00000201443 660 ntTSL 3 BASIC4.82□□□□□ -1.64
Hoxb1P17919 Gm35648-201ENSMUST00000202304 475 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
Hoxb1P17919 Gm33962-202ENSMUST00000205195 630 ntTSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
Hoxb1P17919 4930505K13Rik-201ENSMUST00000208641 546 ntTSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
Hoxb1P17919 Gm45380-201ENSMUST00000210465 315 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
Hoxb1P17919 Gm45772-201ENSMUST00000212961 240 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
Hoxb1P17919 AC159821.1-201ENSMUST00000214934 248 ntTSL 3 BASIC4.82□□□□□ -1.64
Hoxb1P17919 AC159475.1-201ENSMUST00000216752 411 ntTSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
Hoxb1P17919 Gm36543-201ENSMUST00000217933 542 ntTSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
Hoxb1P17919 Gm46194-201ENSMUST00000218136 320 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
Hoxb1P17919 AC122298.1-201ENSMUST00000222574 165 ntTSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
Hoxb1P17919 AC165347.1-201ENSMUST00000224089 1025 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
Hoxb1P17919 AC154616.2-201ENSMUST00000227978 398 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
Hoxb1P17919 CT009600.1-201ENSMUST00000228771 337 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
Hoxb1P17919 Rpl31-ps13-201ENSMUST00000060994 378 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
Hoxb1P17919 Gm4987-201ENSMUST00000078326 408 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
Hoxb1P17919 Rpl31-ps1-201ENSMUST00000085128 378 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
Hoxb1P17919 AC152414.1-201ENSMUST00000218784 2287 ntTSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
Hoxb1P17919 Gm45378-201ENSMUST00000211063 2711 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
Hoxb1P17919 Gucy2f-201ENSMUST00000042530 8122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 96.8 ms