Protein–RNA interactions for Protein: O89093

Ccl20, C-C motif chemokine 20, mousemouse

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Length 97 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl20O89093 Gm24060-201ENSMUST00000157494 95 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
Ccl20O89093 Gm23754-201ENSMUST00000157576 63 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
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Ccl20O89093 Gm21883-201ENSMUST00000179028 372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.6□□□□□ -1.99
Ccl20O89093 Gm21789-201ENSMUST00000179547 372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.6□□□□□ -1.99
Ccl20O89093 Gm21870-201ENSMUST00000179973 372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.6□□□□□ -1.99
Ccl20O89093 Gm26722-201ENSMUST00000181237 1048 ntTSL 5 BASIC2.6□□□□□ -1.99
Ccl20O89093 Gm27342-201ENSMUST00000183530 109 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
Ccl20O89093 Gm27700-201ENSMUST00000185003 81 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
Ccl20O89093 Gm18727-201ENSMUST00000185981 553 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
Ccl20O89093 Gm28598-201ENSMUST00000186490 615 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
Ccl20O89093 4930532M18Rik-201ENSMUST00000187189 481 ntTSL 1 (best) BASIC2.6□□□□□ -1.99
Ccl20O89093 Gm29268-201ENSMUST00000188669 615 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
Ccl20O89093 Gm29218-205ENSMUST00000190846 615 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
Ccl20O89093 Gm28978-201ENSMUST00000191120 615 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
Ccl20O89093 Gm37172-201ENSMUST00000191926 615 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
Ccl20O89093 Gm6321-201ENSMUST00000194460 1090 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
Ccl20O89093 2900035J10Rik-201ENSMUST00000194966 532 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
Ccl20O89093 Gm30275-202ENSMUST00000198124 416 ntTSL 3 BASIC2.6□□□□□ -1.99
Ccl20O89093 Gm43393-201ENSMUST00000200147 194 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
Ccl20O89093 Gm45420-201ENSMUST00000211243 425 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
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Ccl20O89093 Gm7198-201ENSMUST00000219635 1074 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
Ccl20O89093 AC126275.1-201ENSMUST00000224881 446 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
Ccl20O89093 Olfr853-201ENSMUST00000058296 918 ntAPPRIS P1 BASIC2.6□□□□□ -1.99
Ccl20O89093 Tas2r124-201ENSMUST00000076150 930 ntAPPRIS P1 BASIC2.6□□□□□ -1.99
Ccl20O89093 4930522H14Rik-201ENSMUST00000082306 849 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.6□□□□□ -1.99
Ccl20O89093 Gm22304-201ENSMUST00000082688 129 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
Ccl20O89093 Gm5416-201ENSMUST00000089628 294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.6□□□□□ -1.99
Ccl20O89093 Muc16-204ENSMUST00000208663 25437 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.6□□□□□ -1.99
Ccl20O89093 Gm4567-202ENSMUST00000190554 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.6□□□□□ -1.99
Ccl20O89093 Gm10668-202ENSMUST00000191073 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.6□□□□□ -1.99
Ccl20O89093 Gm43879-201ENSMUST00000203811 3760 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
Ccl20O89093 Gm9496-201ENSMUST00000191295 1601 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
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Ccl20O89093 Gm21033-201ENSMUST00000208590 2608 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
Ccl20O89093 AU041133-201ENSMUST00000105314 1494 ntTSL 5 BASIC2.59□□□□□ -1.99
Ccl20O89093 Olfr732-202ENSMUST00000213701 3862 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.59□□□□□ -1.99
Ccl20O89093 Gm609-201ENSMUST00000114585 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -1.99
Ccl20O89093 Sult2a8-201ENSMUST00000063509 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -1.99
Ccl20O89093 A530053G22Rik-201ENSMUST00000060147 1526 ntTSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -1.99
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Ccl20O89093 Gm15087-201ENSMUST00000117465 1172 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
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Ccl20O89093 Taf1d-202ENSMUST00000164079 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -1.99
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Ccl20O89093 Gm21320-201ENSMUST00000211875 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -1.99
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Ccl20O89093 Gm15773-201ENSMUST00000118665 1448 ntBASIC2.59□□□□□ -2
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Ccl20O89093 Gm14416-201ENSMUST00000118630 2308 ntBASIC2.58□□□□□ -2
Ccl20O89093 Zfp85-202ENSMUST00000144183 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
Ccl20O89093 Trav6-7-dv9-201ENSMUST00000103638 379 ntAPPRIS P1 BASIC2.58□□□□□ -2
Ccl20O89093 Gm24792-201ENSMUST00000104286 128 ntBASIC2.58□□□□□ -2
Ccl20O89093 Cav1-203ENSMUST00000115454 613 ntTSL 2 BASIC2.58□□□□□ -2
Ccl20O89093 Gm16431-201ENSMUST00000117454 431 ntBASIC2.58□□□□□ -2
Ccl20O89093 Gm12902-201ENSMUST00000118389 322 ntBASIC2.58□□□□□ -2
Ccl20O89093 Gm6591-201ENSMUST00000121063 434 ntBASIC2.58□□□□□ -2
Ccl20O89093 Mup-ps20-201ENSMUST00000121132 389 ntBASIC2.58□□□□□ -2
Ccl20O89093 Zfp968-203ENSMUST00000131676 1272 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.58□□□□□ -2
Ccl20O89093 Gm16363-201ENSMUST00000132460 877 ntBASIC2.58□□□□□ -2
Ccl20O89093 Cyp3a25-202ENSMUST00000138870 513 ntTSL 3 BASIC2.58□□□□□ -2
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