Protein–RNA interactions for Protein: O35943

Fxn, Frataxin, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 207 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FxnO35943 AC156560.3-201ENSMUST00000222978 3841 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
FxnO35943 Sema3a-201ENSMUST00000030714 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
FxnO35943 Gm10471-201ENSMUST00000094946 2967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.77□□□□□ -1.65
FxnO35943 Gm42559-201ENSMUST00000201811 3532 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
FxnO35943 Gm3623-201ENSMUST00000173643 2747 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
FxnO35943 Vmn1r219-203ENSMUST00000227388 7948 ntAPPRIS P1 BASIC4.76□□□□□ -1.65
FxnO35943 Gm14657-201ENSMUST00000117461 302 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
FxnO35943 Mup12-201ENSMUST00000117932 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
FxnO35943 Gm14220-201ENSMUST00000118114 449 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
FxnO35943 Gm11923-201ENSMUST00000118135 508 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
FxnO35943 Gm13122-201ENSMUST00000118380 453 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
FxnO35943 Gm15803-201ENSMUST00000120118 394 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
FxnO35943 Gm15926-201ENSMUST00000120492 550 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
FxnO35943 Gm14100-201ENSMUST00000125575 651 ntTSL 3 BASIC4.76□□□□□ -1.65
FxnO35943 Gm15338-201ENSMUST00000151884 552 ntTSL 3 BASIC4.76□□□□□ -1.65
FxnO35943 Gm23743-201ENSMUST00000157389 274 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
FxnO35943 Gm24191-201ENSMUST00000157977 122 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
FxnO35943 Gm26001-201ENSMUST00000157989 103 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
FxnO35943 Rps27-201ENSMUST00000170122 345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
FxnO35943 Isx-202ENSMUST00000174427 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
FxnO35943 Gm5558-201ENSMUST00000178933 495 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
FxnO35943 Mir7087-201ENSMUST00000184840 70 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
FxnO35943 1700028M03Rik-201ENSMUST00000185938 476 ntTSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
FxnO35943 Gm28683-201ENSMUST00000187134 615 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
FxnO35943 Gm3604-202ENSMUST00000187656 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
FxnO35943 Gm28840-205ENSMUST00000189320 615 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
FxnO35943 Gm28835-203ENSMUST00000190062 615 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
FxnO35943 Ly6e-215ENSMUST00000191436 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
FxnO35943 Gm5285-201ENSMUST00000193089 666 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
FxnO35943 Gm37416-201ENSMUST00000193596 318 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
FxnO35943 Gm10048-201ENSMUST00000194196 372 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
FxnO35943 Gm38363-202ENSMUST00000195029 622 ntTSL 5 BASIC4.76□□□□□ -1.65
FxnO35943 Gm38032-201ENSMUST00000195052 1589 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
FxnO35943 Gm42639-201ENSMUST00000197061 1871 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
FxnO35943 Gm19666-201ENSMUST00000198176 1893 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
FxnO35943 Gm36535-201ENSMUST00000198395 511 ntTSL 3 BASIC4.76□□□□□ -1.65
FxnO35943 Gm43215-201ENSMUST00000199108 252 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
FxnO35943 Gm43116-201ENSMUST00000199789 195 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
FxnO35943 Olfr278-ps1-201ENSMUST00000205676 238 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
FxnO35943 Gm45101-201ENSMUST00000208327 232 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
FxnO35943 Olfr814-203ENSMUST00000216966 3819 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.76□□□□□ -1.65
FxnO35943 AC163033.1-201ENSMUST00000218608 157 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
FxnO35943 AC108401.1-201ENSMUST00000219740 361 ntTSL 3 BASIC4.76□□□□□ -1.65
FxnO35943 AC156798.1-201ENSMUST00000220508 224 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
FxnO35943 AC165092.3-201ENSMUST00000223602 282 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
FxnO35943 Gm6065-201ENSMUST00000081336 492 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
FxnO35943 Gm25260-201ENSMUST00000083053 134 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
FxnO35943 Kncn-201ENSMUST00000097918 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
FxnO35943 Gm45854-201ENSMUST00000211857 3488 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
FxnO35943 BC003331-204ENSMUST00000097547 2851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.76□□□□□ -1.65
FxnO35943 Vmn1r89-204ENSMUST00000227239 1992 ntAPPRIS P2 BASIC4.76□□□□□ -1.65
FxnO35943 Usf3-204ENSMUST00000169582 12604 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.76□□□□□ -1.65
FxnO35943 Gm8744-201ENSMUST00000204475 3581 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
FxnO35943 Ago2-201ENSMUST00000044113 13705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
FxnO35943 Olfr782-202ENSMUST00000213970 1944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.76□□□□□ -1.65
FxnO35943 Olfr599-202ENSMUST00000214329 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
FxnO35943 Gm5117-201ENSMUST00000178878 2553 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
FxnO35943 Vmn1r185-205ENSMUST00000227461 5318 ntAPPRIS P1 BASIC4.75□□□□□ -1.65
FxnO35943 Zfp715-202ENSMUST00000048015 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
FxnO35943 Olfr1019-202ENSMUST00000213515 3031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
FxnO35943 Wfdc18-201ENSMUST00000001009 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
FxnO35943 Gm11313-201ENSMUST00000118779 432 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
FxnO35943 Gm15603-201ENSMUST00000119252 492 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
FxnO35943 Gm8061-201ENSMUST00000122380 350 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
FxnO35943 Gm16068-201ENSMUST00000136557 504 ntTSL 3 BASIC4.75□□□□□ -1.65
FxnO35943 Gm14330-201ENSMUST00000155455 455 ntTSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
FxnO35943 Gm26400-201ENSMUST00000175012 85 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
FxnO35943 Mir5110-201ENSMUST00000175537 87 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
FxnO35943 Cox6b2-209ENSMUST00000184143 435 ntTSL 2 BASIC4.75□□□□□ -1.65
FxnO35943 Mir7687-201ENSMUST00000184722 59 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
FxnO35943 Gm28385-201ENSMUST00000185671 292 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
FxnO35943 Gm28943-201ENSMUST00000186187 615 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
FxnO35943 Gm28736-201ENSMUST00000186257 615 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
FxnO35943 Gm29401-201ENSMUST00000186690 615 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
FxnO35943 Gm29178-204ENSMUST00000186784 615 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
FxnO35943 Gm28589-201ENSMUST00000186991 615 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
FxnO35943 Gm28936-201ENSMUST00000187153 615 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
FxnO35943 Gm29121-201ENSMUST00000187611 615 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
FxnO35943 Gm28243-201ENSMUST00000187801 615 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
FxnO35943 Gm28844-202ENSMUST00000187977 615 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
FxnO35943 4930533P14Rik-201ENSMUST00000189056 583 ntTSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
FxnO35943 Gm29058-201ENSMUST00000189510 615 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
FxnO35943 Gm29624-201ENSMUST00000190018 615 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
FxnO35943 Gm28780-201ENSMUST00000190223 615 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
FxnO35943 Gm28969-211ENSMUST00000190992 615 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
FxnO35943 Gm28990-207ENSMUST00000191219 615 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
FxnO35943 Gm37338-201ENSMUST00000191986 127 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
FxnO35943 Gm36468-201ENSMUST00000192119 615 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
FxnO35943 Gm32340-201ENSMUST00000192883 259 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
FxnO35943 Gm31572-201ENSMUST00000193341 615 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
FxnO35943 Gm37681-201ENSMUST00000193880 727 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
FxnO35943 Gm30175-201ENSMUST00000194173 615 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
FxnO35943 Gm30858-201ENSMUST00000195516 615 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
FxnO35943 Gm40040-202ENSMUST00000196337 305 ntTSL 3 BASIC4.75□□□□□ -1.65
FxnO35943 Gm33952-201ENSMUST00000197795 408 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
FxnO35943 Gm42542-201ENSMUST00000197978 268 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
FxnO35943 1700011C11Rik-201ENSMUST00000205268 365 ntTSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
FxnO35943 Gm45004-201ENSMUST00000205302 465 ntTSL 2 BASIC4.75□□□□□ -1.65
FxnO35943 Gm18850-201ENSMUST00000211578 388 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
FxnO35943 Gm45616-201ENSMUST00000211711 319 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 83.1 ms