Protein–RNA interactions for Protein: O09165

Casq1, Calsequestrin-1, mousemouse

Predictions only

Length 405 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Casq1O09165 Gm43039-201ENSMUST00000202883 963 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
Casq1O09165 Gm45425-201ENSMUST00000211727 618 ntTSL 2 BASIC3.28□□□□□ -1.88
Casq1O09165 AC154594.1-201ENSMUST00000225171 1273 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
Casq1O09165 1110032A03Rik-202ENSMUST00000042576 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
Casq1O09165 Ssxa1-201ENSMUST00000072593 433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
Casq1O09165 Olfr1201-201ENSMUST00000073458 924 ntAPPRIS P1 BASIC3.28□□□□□ -1.88
Casq1O09165 Gm23264-201ENSMUST00000083372 107 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
Casq1O09165 Gm38706-201ENSMUST00000182397 2617 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
Casq1O09165 Adgrg4-204ENSMUST00000153784 9329 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC3.28□□□□□ -1.88
Casq1O09165 Gm42483-201ENSMUST00000197556 1742 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
Casq1O09165 Gm42852-201ENSMUST00000202649 1379 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
Casq1O09165 Gm597-201ENSMUST00000059937 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.27□□□□□ -1.89
Casq1O09165 Gm42870-201ENSMUST00000199355 3470 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
Casq1O09165 Gm37788-201ENSMUST00000193958 2705 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
Casq1O09165 Olfr309-202ENSMUST00000174158 3293 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.27□□□□□ -1.89
Casq1O09165 Prl2c2-201ENSMUST00000110594 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.27□□□□□ -1.89
Casq1O09165 Gm11665-201ENSMUST00000148136 285 ntTSL 5 BASIC3.27□□□□□ -1.89
Casq1O09165 4930577H14Rik-201ENSMUST00000151367 790 ntTSL 1 (best) BASIC3.27□□□□□ -1.89
Casq1O09165 1700013N06Rik-201ENSMUST00000156376 663 ntTSL 5 BASIC3.27□□□□□ -1.89
Casq1O09165 1700010K23Rik-201ENSMUST00000174502 376 ntTSL 1 (best) BASIC3.27□□□□□ -1.89
Casq1O09165 Gm24520-201ENSMUST00000179510 110 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
Casq1O09165 Gm29576-201ENSMUST00000188020 678 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
Casq1O09165 Gm29423-207ENSMUST00000189580 255 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.27□□□□□ -1.89
Casq1O09165 Gm28354-201ENSMUST00000190904 678 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
Casq1O09165 Gm42812-201ENSMUST00000199844 337 ntTSL 1 (best) BASIC3.27□□□□□ -1.89
Casq1O09165 Gm32381-201ENSMUST00000203192 476 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
Casq1O09165 Gm44633-201ENSMUST00000205925 439 ntTSL 3 BASIC3.27□□□□□ -1.89
Casq1O09165 Olfr485-201ENSMUST00000208296 954 ntAPPRIS P1 BASIC3.27□□□□□ -1.89
Casq1O09165 Gm18015-201ENSMUST00000214879 316 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
Casq1O09165 AC168274.2-201ENSMUST00000219252 338 ntTSL 5 BASIC3.27□□□□□ -1.89
Casq1O09165 Gm6030-201ENSMUST00000078768 402 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
Casq1O09165 Sult2a2-201ENSMUST00000086148 741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.27□□□□□ -1.89
Casq1O09165 Vmn1r76-203ENSMUST00000226947 8145 ntAPPRIS ALT2 BASIC3.26□□□□□ -1.89
Casq1O09165 Vmn2r68-201ENSMUST00000061074 2556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.26□□□□□ -1.89
Casq1O09165 Gm15097-202ENSMUST00000112741 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.26□□□□□ -1.89
Casq1O09165 Gm24951-201ENSMUST00000102182 109 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
Casq1O09165 Gm25420-201ENSMUST00000104216 127 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
Casq1O09165 Gm26341-201ENSMUST00000104561 134 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
Casq1O09165 Gm15561-201ENSMUST00000124326 540 ntTSL 3 BASIC3.26□□□□□ -1.89
Casq1O09165 Gm24745-201ENSMUST00000157840 85 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
Casq1O09165 Pagr1a-201ENSMUST00000162069 422 ntTSL 3 BASIC3.26□□□□□ -1.89
Casq1O09165 1700025F22Rik-202ENSMUST00000180678 658 ntTSL 1 (best) BASIC3.26□□□□□ -1.89
Casq1O09165 1700025F22Rik-204ENSMUST00000181567 578 ntTSL 1 (best) BASIC3.26□□□□□ -1.89
Casq1O09165 1700074A21Rik-201ENSMUST00000192404 346 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
Casq1O09165 Gm43475-201ENSMUST00000196673 400 ntTSL 2 BASIC3.26□□□□□ -1.89
Casq1O09165 Gm18327-201ENSMUST00000202426 830 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
Casq1O09165 Gm43897-201ENSMUST00000204019 309 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
Casq1O09165 Gm19253-201ENSMUST00000204279 307 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
Casq1O09165 Gm43932-201ENSMUST00000204499 52 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
Casq1O09165 AC144942.1-201ENSMUST00000220425 597 ntTSL 5 BASIC3.26□□□□□ -1.89
Casq1O09165 AC158388.1-201ENSMUST00000225441 256 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
Casq1O09165 AC113031.2-201ENSMUST00000226132 579 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
Casq1O09165 1700025F22Rik-201ENSMUST00000078770 650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.26□□□□□ -1.89
Casq1O09165 Vmn1r6-201ENSMUST00000079669 1058 ntAPPRIS P2 BASIC3.26□□□□□ -1.89
Casq1O09165 Gm26458-201ENSMUST00000082832 128 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
Casq1O09165 Olfr1278-201ENSMUST00000090330 942 ntAPPRIS P1 BASIC3.26□□□□□ -1.89
Casq1O09165 CT009510.2-203ENSMUST00000226704 2136 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
Casq1O09165 Tex47-202ENSMUST00000159546 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.26□□□□□ -1.89
Casq1O09165 Skint9-201ENSMUST00000058605 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
Casq1O09165 Gm26696-201ENSMUST00000181941 2848 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
Casq1O09165 Olfr800-202ENSMUST00000217094 3831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.25□□□□□ -1.89
Casq1O09165 Olfr107-203ENSMUST00000215947 3954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.25□□□□□ -1.89
Casq1O09165 Olfr898-203ENSMUST00000217063 4169 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.25□□□□□ -1.89
Casq1O09165 Gm11284-201ENSMUST00000121910 1887 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
Casq1O09165 Gm43665-201ENSMUST00000198672 1659 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
Casq1O09165 Ighv16-1-201ENSMUST00000103470 299 ntAPPRIS P1 BASIC3.25□□□□□ -1.89
Casq1O09165 Gm26075-201ENSMUST00000104062 121 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
Casq1O09165 Gm15087-201ENSMUST00000117465 1172 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
Casq1O09165 Olfr1327-ps1-201ENSMUST00000117953 835 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
Casq1O09165 Gm14901-201ENSMUST00000119001 283 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
Casq1O09165 Gm14739-201ENSMUST00000120424 802 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
Casq1O09165 n-R5s179-201ENSMUST00000122564 118 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
Casq1O09165 Gm22026-201ENSMUST00000122735 281 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
Casq1O09165 Gm13941-201ENSMUST00000127918 736 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.25□□□□□ -1.89
Casq1O09165 Gm25341-201ENSMUST00000157461 268 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
Casq1O09165 Gm22789-201ENSMUST00000157884 130 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
Casq1O09165 Gm24773-201ENSMUST00000158513 99 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
Casq1O09165 Gm24681-201ENSMUST00000158760 107 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
Casq1O09165 1700041C23Rik-201ENSMUST00000185243 395 ntTSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
Casq1O09165 Gm21294-201ENSMUST00000186443 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.25□□□□□ -1.89
Casq1O09165 Gm20888-202ENSMUST00000186890 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
Casq1O09165 Gm21497-201ENSMUST00000189455 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
Casq1O09165 Gm20811-201ENSMUST00000190500 553 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
Casq1O09165 Gm37866-201ENSMUST00000191950 696 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
Casq1O09165 Gm44513-201ENSMUST00000206811 439 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
Casq1O09165 Gm44903-201ENSMUST00000206840 130 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
Casq1O09165 Gm36776-201ENSMUST00000207006 203 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
Casq1O09165 Gm44824-201ENSMUST00000207021 229 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
Casq1O09165 Gm18043-201ENSMUST00000216741 739 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
Casq1O09165 AC132384.9-201ENSMUST00000218085 277 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
Casq1O09165 AC107757.3-201ENSMUST00000226312 535 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
Casq1O09165 AC144819.1-201ENSMUST00000227015 620 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
Casq1O09165 Olfr131-201ENSMUST00000059560 1030 ntAPPRIS P1 BASIC3.25□□□□□ -1.89
Casq1O09165 Bcl2a1c-201ENSMUST00000066460 444 ntAPPRIS P1 BASIC3.25□□□□□ -1.89
Casq1O09165 Olfr657-203ENSMUST00000215454 2397 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.25□□□□□ -1.89
Casq1O09165 Btla-202ENSMUST00000102802 3251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
Casq1O09165 CT025538.3-201ENSMUST00000225279 3848 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
Casq1O09165 Olfr1256-204ENSMUST00000215613 4543 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.24□□□□□ -1.89
Casq1O09165 Gm25764-201ENSMUST00000104092 134 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
Casq1O09165 Cav1-203ENSMUST00000115454 613 ntTSL 2 BASIC3.24□□□□□ -1.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 83 ms