Protein–RNA interactions for Protein: B1ASB6

Spocd1, SPOC domain-containing 1, mousemouse

Predictions only

Length 936 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spocd1B1ASB6 Mmp1a-202ENSMUST00000217651 2011 ntTSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
Spocd1B1ASB6 AC158606.1-201ENSMUST00000220078 325 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
Spocd1B1ASB6 Mmp1a-201ENSMUST00000034492 2022 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.27□□□□□ -1.57
Spocd1B1ASB6 Olfr211-201ENSMUST00000065786 930 ntAPPRIS P1 BASIC5.27□□□□□ -1.57
Spocd1B1ASB6 Gm26228-201ENSMUST00000082512 107 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
Spocd1B1ASB6 Gm25080-201ENSMUST00000082526 107 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
Spocd1B1ASB6 Snord47-201ENSMUST00000083034 77 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
Spocd1B1ASB6 Gm25140-201ENSMUST00000083254 140 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
Spocd1B1ASB6 Gm25126-201ENSMUST00000083343 102 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
Spocd1B1ASB6 Gm25008-201ENSMUST00000083809 81 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
Spocd1B1ASB6 Gm25518-201ENSMUST00000083864 107 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
Spocd1B1ASB6 BC003331-204ENSMUST00000097547 2851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.27□□□□□ -1.57
Spocd1B1ASB6 Vmn2r-ps57-201ENSMUST00000173861 2598 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
Spocd1B1ASB6 Gm26767-201ENSMUST00000180936 4476 ntTSL 5 BASIC5.27□□□□□ -1.57
Spocd1B1ASB6 Gm42616-201ENSMUST00000198989 4184 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
Spocd1B1ASB6 Zfp280c-201ENSMUST00000072292 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
Spocd1B1ASB6 Ints12-201ENSMUST00000029650 3101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
Spocd1B1ASB6 Olfr1348-207ENSMUST00000209029 2696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.27□□□□□ -1.57
Spocd1B1ASB6 AC165106.3-201ENSMUST00000228191 3843 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
Spocd1B1ASB6 Vmn1r217-203ENSMUST00000228656 9767 ntAPPRIS P1 BASIC5.27□□□□□ -1.57
Spocd1B1ASB6 Olfr364-ps1-202ENSMUST00000214905 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.27□□□□□ -1.57
Spocd1B1ASB6 2610300M13Rik-202ENSMUST00000203716 1787 ntTSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
Spocd1B1ASB6 B230206I08Rik-201ENSMUST00000207479 3191 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
Spocd1B1ASB6 Gm5591-201ENSMUST00000079759 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
Spocd1B1ASB6 Gm44518-201ENSMUST00000208080 4370 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
Spocd1B1ASB6 Fbxl17-204ENSMUST00000112840 3667 ntTSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
Spocd1B1ASB6 AC164297.1-201ENSMUST00000224484 1561 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
Spocd1B1ASB6 Olfr586-202ENSMUST00000211075 4562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
Spocd1B1ASB6 Olfr1440-205ENSMUST00000216145 7542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
Spocd1B1ASB6 Ptprd-217ENSMUST00000174023 4530 ntTSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
Spocd1B1ASB6 Ptprd-203ENSMUST00000098005 4542 ntTSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
Spocd1B1ASB6 Mir92b-201ENSMUST00000102300 83 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
Spocd1B1ASB6 Rpl38-ps2-201ENSMUST00000117356 213 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
Spocd1B1ASB6 Gm11633-201ENSMUST00000118176 444 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
Spocd1B1ASB6 Gm8129-201ENSMUST00000118230 213 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
Spocd1B1ASB6 Gm21814-201ENSMUST00000144085 291 ntTSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
Spocd1B1ASB6 Gm24113-201ENSMUST00000157477 276 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
Spocd1B1ASB6 4930556I23Rik-201ENSMUST00000160659 560 ntTSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
Spocd1B1ASB6 Vmn1r-ps68-201ENSMUST00000174638 399 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
Spocd1B1ASB6 Gm23523-201ENSMUST00000180190 107 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
Spocd1B1ASB6 Gm27585-201ENSMUST00000183717 199 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
Spocd1B1ASB6 Mir6363-201ENSMUST00000184880 114 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
Spocd1B1ASB6 Gm28389-201ENSMUST00000190090 697 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
Spocd1B1ASB6 Gm19726-201ENSMUST00000205008 240 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
Spocd1B1ASB6 Gm44859-201ENSMUST00000207831 94 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
Spocd1B1ASB6 Gm45313-201ENSMUST00000210584 178 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
Spocd1B1ASB6 AC153568.1-201ENSMUST00000218165 341 ntTSL 2 BASIC5.26□□□□□ -1.57
Spocd1B1ASB6 AC160931.2-201ENSMUST00000221445 351 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
Spocd1B1ASB6 Olfr308-201ENSMUST00000044256 1056 ntAPPRIS P1 BASIC5.26□□□□□ -1.57
Spocd1B1ASB6 Vmn2r17-201ENSMUST00000171841 2550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
Spocd1B1ASB6 Gm10647-201ENSMUST00000098612 2036 ntAPPRIS P1 BASIC5.26□□□□□ -1.57
Spocd1B1ASB6 AC187103.2-201ENSMUST00000223605 1617 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
Spocd1B1ASB6 Olfr1331-203ENSMUST00000216589 3139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
Spocd1B1ASB6 Gm44144-201ENSMUST00000203683 1960 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
Spocd1B1ASB6 Gm42548-201ENSMUST00000202669 3933 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
Spocd1B1ASB6 Rnf213-202ENSMUST00000131035 16716 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
Spocd1B1ASB6 Rnf213-201ENSMUST00000093902 16716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
Spocd1B1ASB6 Cfap54-207ENSMUST00000168110 9903 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
Spocd1B1ASB6 Olfr629-202ENSMUST00000213906 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
Spocd1B1ASB6 Gm12845-201ENSMUST00000203629 1767 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
Spocd1B1ASB6 Dbpht2-202ENSMUST00000221311 5341 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
Spocd1B1ASB6 Adam24-201ENSMUST00000051614 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
Spocd1B1ASB6 Nfat5-202ENSMUST00000077440 12773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
Spocd1B1ASB6 Zfp322a-201ENSMUST00000050101 4844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
Spocd1B1ASB6 Foxr2-201ENSMUST00000096265 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
Spocd1B1ASB6 Igkv5-39-201ENSMUST00000103370 287 ntAPPRIS P1 BASIC5.25□□□□□ -1.57
Spocd1B1ASB6 Olfr160-201ENSMUST00000104875 930 ntAPPRIS P1 BASIC5.25□□□□□ -1.57
Spocd1B1ASB6 Ctps2-203ENSMUST00000112300 741 ntTSL 3 BASIC5.25□□□□□ -1.57
Spocd1B1ASB6 Gm11229-201ENSMUST00000121993 437 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
Spocd1B1ASB6 Gm14775-201ENSMUST00000122089 310 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
Spocd1B1ASB6 Gm14697-201ENSMUST00000147144 648 ntTSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
Spocd1B1ASB6 Gm23411-201ENSMUST00000157988 62 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
Spocd1B1ASB6 Gm27928-201ENSMUST00000183747 256 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
Spocd1B1ASB6 Gm37272-201ENSMUST00000193401 488 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
Spocd1B1ASB6 AC125531.1-201ENSMUST00000219849 221 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
Spocd1B1ASB6 Gm37749-201ENSMUST00000193917 1899 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
Spocd1B1ASB6 AC168274.1-201ENSMUST00000218657 1864 ntTSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
Spocd1B1ASB6 Brcc3-202ENSMUST00000114074 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
Spocd1B1ASB6 Gm37115-201ENSMUST00000193750 2849 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
Spocd1B1ASB6 Vmn2r112-201ENSMUST00000097381 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
Spocd1B1ASB6 Olfr812-203ENSMUST00000205013 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
Spocd1B1ASB6 Olfr1242-203ENSMUST00000143935 2406 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
Spocd1B1ASB6 5530601H04Rik-207ENSMUST00000138460 3732 ntTSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
Spocd1B1ASB6 Olfr235-206ENSMUST00000215407 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
Spocd1B1ASB6 Gnrhr-203ENSMUST00000113372 2265 ntTSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
Spocd1B1ASB6 Slc22a30-202ENSMUST00000096269 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
Spocd1B1ASB6 Vmn1r197-203ENSMUST00000227017 5158 ntAPPRIS P1 BASIC5.25□□□□□ -1.57
Spocd1B1ASB6 Olfr1195-202ENSMUST00000213545 2585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
Spocd1B1ASB6 Olfr556-202ENSMUST00000213485 3825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
Spocd1B1ASB6 Olfr685-204ENSMUST00000217432 3246 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
Spocd1B1ASB6 Gm15088-201ENSMUST00000117973 1508 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
Spocd1B1ASB6 Gm15098-201ENSMUST00000119036 1508 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
Spocd1B1ASB6 Clec2e-201ENSMUST00000032258 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
Spocd1B1ASB6 Slc5a12-201ENSMUST00000045972 3529 ntTSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
Spocd1B1ASB6 Gm13046-201ENSMUST00000117391 501 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
Spocd1B1ASB6 Gm14669-201ENSMUST00000118841 250 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
Spocd1B1ASB6 Gm29094-201ENSMUST00000138109 664 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC5.24□□□□□ -1.57
Spocd1B1ASB6 Gm24439-201ENSMUST00000157894 117 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
Spocd1B1ASB6 Gm26354-201ENSMUST00000158221 129 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
Spocd1B1ASB6 Gm23704-201ENSMUST00000158844 340 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 83 ms