Protein–RNA interactions for Protein: W4VSP1

Speer3, MCG129800, mousemouse

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Speer3W4VSP1 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Speer3W4VSP1 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Speer3W4VSP1 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Speer3W4VSP1 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Speer3W4VSP1 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Speer3W4VSP1 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Speer3W4VSP1 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Speer3W4VSP1 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Speer3W4VSP1 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Speer3W4VSP1 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Speer3W4VSP1 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Speer3W4VSP1 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Speer3W4VSP1 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Speer3W4VSP1 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Speer3W4VSP1 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Speer3W4VSP1 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Speer3W4VSP1 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Speer3W4VSP1 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Speer3W4VSP1 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Speer3W4VSP1 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Speer3W4VSP1 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Speer3W4VSP1 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Speer3W4VSP1 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Speer3W4VSP1 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Speer3W4VSP1 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Speer3W4VSP1 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Speer3W4VSP1 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Speer3W4VSP1 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Speer3W4VSP1 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Speer3W4VSP1 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Speer3W4VSP1 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Speer3W4VSP1 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Speer3W4VSP1 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Speer3W4VSP1 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Speer3W4VSP1 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Speer3W4VSP1 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Speer3W4VSP1 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Speer3W4VSP1 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Speer3W4VSP1 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Speer3W4VSP1 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Speer3W4VSP1 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Speer3W4VSP1 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Speer3W4VSP1 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Speer3W4VSP1 AC073947.1-201ENSMUST00000216991 649 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Speer3W4VSP1 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Speer3W4VSP1 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Speer3W4VSP1 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Speer3W4VSP1 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Speer3W4VSP1 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Speer3W4VSP1 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Speer3W4VSP1 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Speer3W4VSP1 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Speer3W4VSP1 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Speer3W4VSP1 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Speer3W4VSP1 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Speer3W4VSP1 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Speer3W4VSP1 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Speer3W4VSP1 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Speer3W4VSP1 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Speer3W4VSP1 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Speer3W4VSP1 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Speer3W4VSP1 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Speer3W4VSP1 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Speer3W4VSP1 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Speer3W4VSP1 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Speer3W4VSP1 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Speer3W4VSP1 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Speer3W4VSP1 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Speer3W4VSP1 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Speer3W4VSP1 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Speer3W4VSP1 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Speer3W4VSP1 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Speer3W4VSP1 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Speer3W4VSP1 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Speer3W4VSP1 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Speer3W4VSP1 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Speer3W4VSP1 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Speer3W4VSP1 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Speer3W4VSP1 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Speer3W4VSP1 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Speer3W4VSP1 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Speer3W4VSP1 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Speer3W4VSP1 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Speer3W4VSP1 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Speer3W4VSP1 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Speer3W4VSP1 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Speer3W4VSP1 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Speer3W4VSP1 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Speer3W4VSP1 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Speer3W4VSP1 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Speer3W4VSP1 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Speer3W4VSP1 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Speer3W4VSP1 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Speer3W4VSP1 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Speer3W4VSP1 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Speer3W4VSP1 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Speer3W4VSP1 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Speer3W4VSP1 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Speer3W4VSP1 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Speer3W4VSP1 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms