Protein–RNA interactions for Protein: W4VSN7

Gm3550, 60S ribosomal protein L29, mousemouse

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Length 160 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3550W4VSN7 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm3550W4VSN7 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm3550W4VSN7 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm3550W4VSN7 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm3550W4VSN7 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm3550W4VSN7 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm3550W4VSN7 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm3550W4VSN7 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm3550W4VSN7 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm3550W4VSN7 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm3550W4VSN7 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm3550W4VSN7 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm3550W4VSN7 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm3550W4VSN7 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm3550W4VSN7 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm3550W4VSN7 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm3550W4VSN7 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm3550W4VSN7 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm3550W4VSN7 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm3550W4VSN7 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm3550W4VSN7 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm3550W4VSN7 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm3550W4VSN7 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm3550W4VSN7 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm3550W4VSN7 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm3550W4VSN7 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm3550W4VSN7 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm3550W4VSN7 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm3550W4VSN7 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm3550W4VSN7 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm3550W4VSN7 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm3550W4VSN7 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm3550W4VSN7 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm3550W4VSN7 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm3550W4VSN7 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm3550W4VSN7 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm3550W4VSN7 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm3550W4VSN7 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm3550W4VSN7 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm3550W4VSN7 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm3550W4VSN7 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm3550W4VSN7 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm3550W4VSN7 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm3550W4VSN7 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm3550W4VSN7 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm3550W4VSN7 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm3550W4VSN7 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm3550W4VSN7 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm3550W4VSN7 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm3550W4VSN7 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm3550W4VSN7 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm3550W4VSN7 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm3550W4VSN7 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm3550W4VSN7 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm3550W4VSN7 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm3550W4VSN7 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm3550W4VSN7 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm3550W4VSN7 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm3550W4VSN7 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm3550W4VSN7 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm3550W4VSN7 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm3550W4VSN7 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm3550W4VSN7 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm3550W4VSN7 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm3550W4VSN7 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm3550W4VSN7 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm3550W4VSN7 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm3550W4VSN7 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm3550W4VSN7 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm3550W4VSN7 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm3550W4VSN7 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm3550W4VSN7 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm3550W4VSN7 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm3550W4VSN7 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm3550W4VSN7 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm3550W4VSN7 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm3550W4VSN7 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm3550W4VSN7 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm3550W4VSN7 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm3550W4VSN7 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm3550W4VSN7 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm3550W4VSN7 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm3550W4VSN7 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm3550W4VSN7 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm3550W4VSN7 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm3550W4VSN7 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm3550W4VSN7 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm3550W4VSN7 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm3550W4VSN7 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm3550W4VSN7 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm3550W4VSN7 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm3550W4VSN7 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm3550W4VSN7 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm3550W4VSN7 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm3550W4VSN7 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm3550W4VSN7 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm3550W4VSN7 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm3550W4VSN7 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm3550W4VSN7 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm3550W4VSN7 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
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