Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2D7

Mbd4, Methyl-CpG-binding domain protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 554 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mbd4Q9Z2D7 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Mbd4Q9Z2D7 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Mbd4Q9Z2D7 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Mbd4Q9Z2D7 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Mbd4Q9Z2D7 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Mbd4Q9Z2D7 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Mbd4Q9Z2D7 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Mbd4Q9Z2D7 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Mbd4Q9Z2D7 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Mbd4Q9Z2D7 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Mbd4Q9Z2D7 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Mbd4Q9Z2D7 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Mbd4Q9Z2D7 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Mbd4Q9Z2D7 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Mbd4Q9Z2D7 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Mbd4Q9Z2D7 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Mbd4Q9Z2D7 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Mbd4Q9Z2D7 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Mbd4Q9Z2D7 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Mbd4Q9Z2D7 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Mbd4Q9Z2D7 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Mbd4Q9Z2D7 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Mbd4Q9Z2D7 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Mbd4Q9Z2D7 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Mbd4Q9Z2D7 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Mbd4Q9Z2D7 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Mbd4Q9Z2D7 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Mbd4Q9Z2D7 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Mbd4Q9Z2D7 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Mbd4Q9Z2D7 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Mbd4Q9Z2D7 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Mbd4Q9Z2D7 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Mbd4Q9Z2D7 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Mbd4Q9Z2D7 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Mbd4Q9Z2D7 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Mbd4Q9Z2D7 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Mbd4Q9Z2D7 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Mbd4Q9Z2D7 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Mbd4Q9Z2D7 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Mbd4Q9Z2D7 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Mbd4Q9Z2D7 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Mbd4Q9Z2D7 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Mbd4Q9Z2D7 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Mbd4Q9Z2D7 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Mbd4Q9Z2D7 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Mbd4Q9Z2D7 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Mbd4Q9Z2D7 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Mbd4Q9Z2D7 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Mbd4Q9Z2D7 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Mbd4Q9Z2D7 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Mbd4Q9Z2D7 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Mbd4Q9Z2D7 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Mbd4Q9Z2D7 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Mbd4Q9Z2D7 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Mbd4Q9Z2D7 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Mbd4Q9Z2D7 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Mbd4Q9Z2D7 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Mbd4Q9Z2D7 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Mbd4Q9Z2D7 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Mbd4Q9Z2D7 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Mbd4Q9Z2D7 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Mbd4Q9Z2D7 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Mbd4Q9Z2D7 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Mbd4Q9Z2D7 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Mbd4Q9Z2D7 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Mbd4Q9Z2D7 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Mbd4Q9Z2D7 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Mbd4Q9Z2D7 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Mbd4Q9Z2D7 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.26
Mbd4Q9Z2D7 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Mbd4Q9Z2D7 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Mbd4Q9Z2D7 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Mbd4Q9Z2D7 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Mbd4Q9Z2D7 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Mbd4Q9Z2D7 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Mbd4Q9Z2D7 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Mbd4Q9Z2D7 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Mbd4Q9Z2D7 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Mbd4Q9Z2D7 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Mbd4Q9Z2D7 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Mbd4Q9Z2D7 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Mbd4Q9Z2D7 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Mbd4Q9Z2D7 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Mbd4Q9Z2D7 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Mbd4Q9Z2D7 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Mbd4Q9Z2D7 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Mbd4Q9Z2D7 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Mbd4Q9Z2D7 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Mbd4Q9Z2D7 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Mbd4Q9Z2D7 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Mbd4Q9Z2D7 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Mbd4Q9Z2D7 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Mbd4Q9Z2D7 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Mbd4Q9Z2D7 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Mbd4Q9Z2D7 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Mbd4Q9Z2D7 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Mbd4Q9Z2D7 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Mbd4Q9Z2D7 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Mbd4Q9Z2D7 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Mbd4Q9Z2D7 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.1 ms