Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z275

Rlbp1, Retinaldehyde-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 317 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rlbp1Q9Z275 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rlbp1Q9Z275 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rlbp1Q9Z275 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rlbp1Q9Z275 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rlbp1Q9Z275 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rlbp1Q9Z275 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rlbp1Q9Z275 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rlbp1Q9Z275 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rlbp1Q9Z275 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Rlbp1Q9Z275 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Rlbp1Q9Z275 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rlbp1Q9Z275 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rlbp1Q9Z275 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Rlbp1Q9Z275 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rlbp1Q9Z275 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rlbp1Q9Z275 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rlbp1Q9Z275 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rlbp1Q9Z275 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rlbp1Q9Z275 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rlbp1Q9Z275 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rlbp1Q9Z275 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rlbp1Q9Z275 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rlbp1Q9Z275 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rlbp1Q9Z275 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rlbp1Q9Z275 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rlbp1Q9Z275 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rlbp1Q9Z275 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rlbp1Q9Z275 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rlbp1Q9Z275 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rlbp1Q9Z275 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rlbp1Q9Z275 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rlbp1Q9Z275 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Rlbp1Q9Z275 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Rlbp1Q9Z275 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Rlbp1Q9Z275 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Rlbp1Q9Z275 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Rlbp1Q9Z275 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Rlbp1Q9Z275 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Rlbp1Q9Z275 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Rlbp1Q9Z275 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Rlbp1Q9Z275 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Rlbp1Q9Z275 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Rlbp1Q9Z275 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC21.33■■□□□ 1
Rlbp1Q9Z275 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Rlbp1Q9Z275 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Rlbp1Q9Z275 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Rlbp1Q9Z275 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Rlbp1Q9Z275 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Rlbp1Q9Z275 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Rlbp1Q9Z275 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Rlbp1Q9Z275 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Rlbp1Q9Z275 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Rlbp1Q9Z275 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
Rlbp1Q9Z275 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Rlbp1Q9Z275 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Rlbp1Q9Z275 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Rlbp1Q9Z275 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Rlbp1Q9Z275 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Rlbp1Q9Z275 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Rlbp1Q9Z275 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Rlbp1Q9Z275 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Rlbp1Q9Z275 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Rlbp1Q9Z275 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Rlbp1Q9Z275 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Rlbp1Q9Z275 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
Rlbp1Q9Z275 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Rlbp1Q9Z275 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Rlbp1Q9Z275 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Rlbp1Q9Z275 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Rlbp1Q9Z275 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Rlbp1Q9Z275 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Rlbp1Q9Z275 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Rlbp1Q9Z275 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
Rlbp1Q9Z275 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Rlbp1Q9Z275 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Rlbp1Q9Z275 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Rlbp1Q9Z275 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Rlbp1Q9Z275 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Rlbp1Q9Z275 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Rlbp1Q9Z275 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Rlbp1Q9Z275 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Rlbp1Q9Z275 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Rlbp1Q9Z275 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
Rlbp1Q9Z275 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Rlbp1Q9Z275 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Rlbp1Q9Z275 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Rlbp1Q9Z275 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Rlbp1Q9Z275 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Rlbp1Q9Z275 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
Rlbp1Q9Z275 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Rlbp1Q9Z275 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Rlbp1Q9Z275 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Rlbp1Q9Z275 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Rlbp1Q9Z275 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Rlbp1Q9Z275 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Rlbp1Q9Z275 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Rlbp1Q9Z275 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Rlbp1Q9Z275 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Rlbp1Q9Z275 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Rlbp1Q9Z275 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.5 ms