Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z261

Cldn7, Claudin-7, mousemouse

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Length 211 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn7Q9Z261 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cldn7Q9Z261 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cldn7Q9Z261 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cldn7Q9Z261 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Cldn7Q9Z261 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Cldn7Q9Z261 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Cldn7Q9Z261 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Cldn7Q9Z261 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cldn7Q9Z261 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cldn7Q9Z261 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cldn7Q9Z261 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cldn7Q9Z261 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cldn7Q9Z261 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cldn7Q9Z261 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cldn7Q9Z261 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cldn7Q9Z261 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Cldn7Q9Z261 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Cldn7Q9Z261 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Cldn7Q9Z261 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cldn7Q9Z261 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cldn7Q9Z261 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Cldn7Q9Z261 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Cldn7Q9Z261 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cldn7Q9Z261 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cldn7Q9Z261 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cldn7Q9Z261 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cldn7Q9Z261 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cldn7Q9Z261 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cldn7Q9Z261 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cldn7Q9Z261 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cldn7Q9Z261 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cldn7Q9Z261 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cldn7Q9Z261 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cldn7Q9Z261 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Cldn7Q9Z261 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Cldn7Q9Z261 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cldn7Q9Z261 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cldn7Q9Z261 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Cldn7Q9Z261 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cldn7Q9Z261 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cldn7Q9Z261 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Cldn7Q9Z261 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Cldn7Q9Z261 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Cldn7Q9Z261 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Cldn7Q9Z261 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
Cldn7Q9Z261 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cldn7Q9Z261 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC17■□□□□ 0.31
Cldn7Q9Z261 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Cldn7Q9Z261 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Cldn7Q9Z261 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cldn7Q9Z261 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cldn7Q9Z261 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cldn7Q9Z261 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Cldn7Q9Z261 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cldn7Q9Z261 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cldn7Q9Z261 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Cldn7Q9Z261 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cldn7Q9Z261 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cldn7Q9Z261 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Cldn7Q9Z261 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cldn7Q9Z261 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cldn7Q9Z261 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cldn7Q9Z261 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cldn7Q9Z261 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cldn7Q9Z261 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cldn7Q9Z261 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cldn7Q9Z261 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cldn7Q9Z261 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cldn7Q9Z261 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cldn7Q9Z261 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cldn7Q9Z261 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cldn7Q9Z261 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cldn7Q9Z261 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cldn7Q9Z261 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cldn7Q9Z261 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Cldn7Q9Z261 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cldn7Q9Z261 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cldn7Q9Z261 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Cldn7Q9Z261 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cldn7Q9Z261 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cldn7Q9Z261 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cldn7Q9Z261 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cldn7Q9Z261 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cldn7Q9Z261 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cldn7Q9Z261 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cldn7Q9Z261 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cldn7Q9Z261 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cldn7Q9Z261 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cldn7Q9Z261 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cldn7Q9Z261 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cldn7Q9Z261 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cldn7Q9Z261 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cldn7Q9Z261 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cldn7Q9Z261 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cldn7Q9Z261 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cldn7Q9Z261 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cldn7Q9Z261 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Cldn7Q9Z261 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cldn7Q9Z261 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cldn7Q9Z261 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.8 ms