Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1Y4

Trip6, Thyroid receptor-interacting protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 480 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trip6Q9Z1Y4 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Trip6Q9Z1Y4 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Trip6Q9Z1Y4 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
Trip6Q9Z1Y4 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
Trip6Q9Z1Y4 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Trip6Q9Z1Y4 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Trip6Q9Z1Y4 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Trip6Q9Z1Y4 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Trip6Q9Z1Y4 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Trip6Q9Z1Y4 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Trip6Q9Z1Y4 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Trip6Q9Z1Y4 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Trip6Q9Z1Y4 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Trip6Q9Z1Y4 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Trip6Q9Z1Y4 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Trip6Q9Z1Y4 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Trip6Q9Z1Y4 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Trip6Q9Z1Y4 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Trip6Q9Z1Y4 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Trip6Q9Z1Y4 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Trip6Q9Z1Y4 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Trip6Q9Z1Y4 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Trip6Q9Z1Y4 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Trip6Q9Z1Y4 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Trip6Q9Z1Y4 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Trip6Q9Z1Y4 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Trip6Q9Z1Y4 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Trip6Q9Z1Y4 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Trip6Q9Z1Y4 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Trip6Q9Z1Y4 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Trip6Q9Z1Y4 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Trip6Q9Z1Y4 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Trip6Q9Z1Y4 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Trip6Q9Z1Y4 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Trip6Q9Z1Y4 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Trip6Q9Z1Y4 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Trip6Q9Z1Y4 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Trip6Q9Z1Y4 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Trip6Q9Z1Y4 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Trip6Q9Z1Y4 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Trip6Q9Z1Y4 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Trip6Q9Z1Y4 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Trip6Q9Z1Y4 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Trip6Q9Z1Y4 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Trip6Q9Z1Y4 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Trip6Q9Z1Y4 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Trip6Q9Z1Y4 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Trip6Q9Z1Y4 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Trip6Q9Z1Y4 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Trip6Q9Z1Y4 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Trip6Q9Z1Y4 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Trip6Q9Z1Y4 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Trip6Q9Z1Y4 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Trip6Q9Z1Y4 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Trip6Q9Z1Y4 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Trip6Q9Z1Y4 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Trip6Q9Z1Y4 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Trip6Q9Z1Y4 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Trip6Q9Z1Y4 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Trip6Q9Z1Y4 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Trip6Q9Z1Y4 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Trip6Q9Z1Y4 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Trip6Q9Z1Y4 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Trip6Q9Z1Y4 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Trip6Q9Z1Y4 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Trip6Q9Z1Y4 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Trip6Q9Z1Y4 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Trip6Q9Z1Y4 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Trip6Q9Z1Y4 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Trip6Q9Z1Y4 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Trip6Q9Z1Y4 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Trip6Q9Z1Y4 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Trip6Q9Z1Y4 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Trip6Q9Z1Y4 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Trip6Q9Z1Y4 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Trip6Q9Z1Y4 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Trip6Q9Z1Y4 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Trip6Q9Z1Y4 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Trip6Q9Z1Y4 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Trip6Q9Z1Y4 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Trip6Q9Z1Y4 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Trip6Q9Z1Y4 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Trip6Q9Z1Y4 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Trip6Q9Z1Y4 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Trip6Q9Z1Y4 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Trip6Q9Z1Y4 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Trip6Q9Z1Y4 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Trip6Q9Z1Y4 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Trip6Q9Z1Y4 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Trip6Q9Z1Y4 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Trip6Q9Z1Y4 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Trip6Q9Z1Y4 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Trip6Q9Z1Y4 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Trip6Q9Z1Y4 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Trip6Q9Z1Y4 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Trip6Q9Z1Y4 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Trip6Q9Z1Y4 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Trip6Q9Z1Y4 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Trip6Q9Z1Y4 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Trip6Q9Z1Y4 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.5 ms