Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1B8

Phf1, PHD finger protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phf1Q9Z1B8 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Phf1Q9Z1B8 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Phf1Q9Z1B8 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Phf1Q9Z1B8 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Phf1Q9Z1B8 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Phf1Q9Z1B8 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Phf1Q9Z1B8 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Phf1Q9Z1B8 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Phf1Q9Z1B8 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Phf1Q9Z1B8 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Phf1Q9Z1B8 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Phf1Q9Z1B8 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Phf1Q9Z1B8 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Phf1Q9Z1B8 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Phf1Q9Z1B8 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Phf1Q9Z1B8 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Phf1Q9Z1B8 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Phf1Q9Z1B8 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Phf1Q9Z1B8 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Phf1Q9Z1B8 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Phf1Q9Z1B8 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Phf1Q9Z1B8 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Phf1Q9Z1B8 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Phf1Q9Z1B8 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Phf1Q9Z1B8 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Phf1Q9Z1B8 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Phf1Q9Z1B8 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Phf1Q9Z1B8 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Phf1Q9Z1B8 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Phf1Q9Z1B8 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Phf1Q9Z1B8 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Phf1Q9Z1B8 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Phf1Q9Z1B8 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Phf1Q9Z1B8 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Phf1Q9Z1B8 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Phf1Q9Z1B8 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Phf1Q9Z1B8 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Phf1Q9Z1B8 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Phf1Q9Z1B8 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Phf1Q9Z1B8 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Phf1Q9Z1B8 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Phf1Q9Z1B8 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Phf1Q9Z1B8 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Phf1Q9Z1B8 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Phf1Q9Z1B8 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Phf1Q9Z1B8 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Phf1Q9Z1B8 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Phf1Q9Z1B8 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Phf1Q9Z1B8 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Phf1Q9Z1B8 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Phf1Q9Z1B8 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Phf1Q9Z1B8 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Phf1Q9Z1B8 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Phf1Q9Z1B8 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Phf1Q9Z1B8 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Phf1Q9Z1B8 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Phf1Q9Z1B8 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Phf1Q9Z1B8 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Phf1Q9Z1B8 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Phf1Q9Z1B8 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Phf1Q9Z1B8 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Phf1Q9Z1B8 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Phf1Q9Z1B8 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Phf1Q9Z1B8 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Phf1Q9Z1B8 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Phf1Q9Z1B8 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Phf1Q9Z1B8 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Phf1Q9Z1B8 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Phf1Q9Z1B8 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Phf1Q9Z1B8 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Phf1Q9Z1B8 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Phf1Q9Z1B8 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Phf1Q9Z1B8 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Phf1Q9Z1B8 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Phf1Q9Z1B8 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Phf1Q9Z1B8 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Phf1Q9Z1B8 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Phf1Q9Z1B8 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Phf1Q9Z1B8 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Phf1Q9Z1B8 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Phf1Q9Z1B8 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Phf1Q9Z1B8 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Phf1Q9Z1B8 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Phf1Q9Z1B8 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Phf1Q9Z1B8 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Phf1Q9Z1B8 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Phf1Q9Z1B8 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Phf1Q9Z1B8 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Phf1Q9Z1B8 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Phf1Q9Z1B8 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Phf1Q9Z1B8 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Phf1Q9Z1B8 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Phf1Q9Z1B8 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Phf1Q9Z1B8 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Phf1Q9Z1B8 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Phf1Q9Z1B8 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Phf1Q9Z1B8 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Phf1Q9Z1B8 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Phf1Q9Z1B8 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Phf1Q9Z1B8 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.9 ms