Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z179

Shcbp1, SHC SH2 domain-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 668 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shcbp1Q9Z179 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Shcbp1Q9Z179 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Shcbp1Q9Z179 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Shcbp1Q9Z179 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Shcbp1Q9Z179 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Shcbp1Q9Z179 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Shcbp1Q9Z179 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Shcbp1Q9Z179 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Shcbp1Q9Z179 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Shcbp1Q9Z179 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Shcbp1Q9Z179 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Shcbp1Q9Z179 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Shcbp1Q9Z179 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Shcbp1Q9Z179 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Shcbp1Q9Z179 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Shcbp1Q9Z179 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Shcbp1Q9Z179 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Shcbp1Q9Z179 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Shcbp1Q9Z179 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Shcbp1Q9Z179 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Shcbp1Q9Z179 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Shcbp1Q9Z179 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Shcbp1Q9Z179 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Shcbp1Q9Z179 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Shcbp1Q9Z179 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Shcbp1Q9Z179 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Shcbp1Q9Z179 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Shcbp1Q9Z179 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Shcbp1Q9Z179 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Shcbp1Q9Z179 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Shcbp1Q9Z179 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Shcbp1Q9Z179 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Shcbp1Q9Z179 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Shcbp1Q9Z179 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Shcbp1Q9Z179 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Shcbp1Q9Z179 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Shcbp1Q9Z179 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Shcbp1Q9Z179 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Shcbp1Q9Z179 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Shcbp1Q9Z179 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Shcbp1Q9Z179 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Shcbp1Q9Z179 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Shcbp1Q9Z179 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Shcbp1Q9Z179 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Shcbp1Q9Z179 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Shcbp1Q9Z179 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Shcbp1Q9Z179 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Shcbp1Q9Z179 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Shcbp1Q9Z179 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Shcbp1Q9Z179 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Shcbp1Q9Z179 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Shcbp1Q9Z179 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Shcbp1Q9Z179 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Shcbp1Q9Z179 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Shcbp1Q9Z179 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Shcbp1Q9Z179 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Shcbp1Q9Z179 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Shcbp1Q9Z179 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Shcbp1Q9Z179 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Shcbp1Q9Z179 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Shcbp1Q9Z179 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Shcbp1Q9Z179 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Shcbp1Q9Z179 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Shcbp1Q9Z179 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Shcbp1Q9Z179 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Shcbp1Q9Z179 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Shcbp1Q9Z179 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Shcbp1Q9Z179 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Shcbp1Q9Z179 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Shcbp1Q9Z179 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Shcbp1Q9Z179 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Shcbp1Q9Z179 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Shcbp1Q9Z179 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Shcbp1Q9Z179 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Shcbp1Q9Z179 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Shcbp1Q9Z179 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Shcbp1Q9Z179 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Shcbp1Q9Z179 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Shcbp1Q9Z179 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Shcbp1Q9Z179 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Shcbp1Q9Z179 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Shcbp1Q9Z179 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Shcbp1Q9Z179 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Shcbp1Q9Z179 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Shcbp1Q9Z179 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Shcbp1Q9Z179 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Shcbp1Q9Z179 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Shcbp1Q9Z179 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Shcbp1Q9Z179 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Shcbp1Q9Z179 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Shcbp1Q9Z179 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Shcbp1Q9Z179 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Shcbp1Q9Z179 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Shcbp1Q9Z179 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Shcbp1Q9Z179 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Shcbp1Q9Z179 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Shcbp1Q9Z179 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Shcbp1Q9Z179 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Shcbp1Q9Z179 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Shcbp1Q9Z179 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.7 ms