Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z140

Cpne6, Copine-6, mousemouse

Predictions only

Length 557 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpne6Q9Z140 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cpne6Q9Z140 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cpne6Q9Z140 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cpne6Q9Z140 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cpne6Q9Z140 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cpne6Q9Z140 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cpne6Q9Z140 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cpne6Q9Z140 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cpne6Q9Z140 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cpne6Q9Z140 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Cpne6Q9Z140 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cpne6Q9Z140 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cpne6Q9Z140 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cpne6Q9Z140 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cpne6Q9Z140 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cpne6Q9Z140 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cpne6Q9Z140 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cpne6Q9Z140 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cpne6Q9Z140 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cpne6Q9Z140 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Cpne6Q9Z140 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cpne6Q9Z140 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cpne6Q9Z140 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cpne6Q9Z140 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cpne6Q9Z140 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cpne6Q9Z140 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cpne6Q9Z140 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cpne6Q9Z140 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cpne6Q9Z140 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cpne6Q9Z140 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cpne6Q9Z140 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cpne6Q9Z140 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cpne6Q9Z140 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Cpne6Q9Z140 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Cpne6Q9Z140 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Cpne6Q9Z140 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cpne6Q9Z140 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cpne6Q9Z140 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cpne6Q9Z140 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cpne6Q9Z140 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cpne6Q9Z140 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cpne6Q9Z140 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cpne6Q9Z140 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cpne6Q9Z140 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cpne6Q9Z140 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cpne6Q9Z140 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cpne6Q9Z140 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cpne6Q9Z140 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cpne6Q9Z140 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cpne6Q9Z140 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cpne6Q9Z140 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cpne6Q9Z140 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cpne6Q9Z140 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cpne6Q9Z140 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cpne6Q9Z140 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cpne6Q9Z140 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cpne6Q9Z140 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cpne6Q9Z140 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cpne6Q9Z140 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cpne6Q9Z140 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cpne6Q9Z140 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cpne6Q9Z140 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cpne6Q9Z140 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cpne6Q9Z140 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cpne6Q9Z140 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Cpne6Q9Z140 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cpne6Q9Z140 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cpne6Q9Z140 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cpne6Q9Z140 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cpne6Q9Z140 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cpne6Q9Z140 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cpne6Q9Z140 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cpne6Q9Z140 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cpne6Q9Z140 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cpne6Q9Z140 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cpne6Q9Z140 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cpne6Q9Z140 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cpne6Q9Z140 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cpne6Q9Z140 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cpne6Q9Z140 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cpne6Q9Z140 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cpne6Q9Z140 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cpne6Q9Z140 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cpne6Q9Z140 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cpne6Q9Z140 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Cpne6Q9Z140 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cpne6Q9Z140 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cpne6Q9Z140 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cpne6Q9Z140 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cpne6Q9Z140 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cpne6Q9Z140 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cpne6Q9Z140 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cpne6Q9Z140 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cpne6Q9Z140 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cpne6Q9Z140 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cpne6Q9Z140 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cpne6Q9Z140 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cpne6Q9Z140 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cpne6Q9Z140 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cpne6Q9Z140 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 86.4 ms