Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0M3

Cdh20, Cadherin-20, mousemouse

Predictions only

Length 801 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdh20Q9Z0M3 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cdh20Q9Z0M3 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cdh20Q9Z0M3 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cdh20Q9Z0M3 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cdh20Q9Z0M3 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cdh20Q9Z0M3 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cdh20Q9Z0M3 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cdh20Q9Z0M3 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cdh20Q9Z0M3 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
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Cdh20Q9Z0M3 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cdh20Q9Z0M3 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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Cdh20Q9Z0M3 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cdh20Q9Z0M3 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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Cdh20Q9Z0M3 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cdh20Q9Z0M3 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cdh20Q9Z0M3 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cdh20Q9Z0M3 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cdh20Q9Z0M3 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cdh20Q9Z0M3 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cdh20Q9Z0M3 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Cdh20Q9Z0M3 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cdh20Q9Z0M3 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cdh20Q9Z0M3 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Cdh20Q9Z0M3 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cdh20Q9Z0M3 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cdh20Q9Z0M3 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cdh20Q9Z0M3 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cdh20Q9Z0M3 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cdh20Q9Z0M3 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cdh20Q9Z0M3 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cdh20Q9Z0M3 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cdh20Q9Z0M3 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cdh20Q9Z0M3 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
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Cdh20Q9Z0M3 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cdh20Q9Z0M3 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cdh20Q9Z0M3 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Cdh20Q9Z0M3 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cdh20Q9Z0M3 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cdh20Q9Z0M3 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cdh20Q9Z0M3 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cdh20Q9Z0M3 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cdh20Q9Z0M3 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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Cdh20Q9Z0M3 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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Cdh20Q9Z0M3 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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Cdh20Q9Z0M3 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cdh20Q9Z0M3 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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Cdh20Q9Z0M3 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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Cdh20Q9Z0M3 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cdh20Q9Z0M3 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Cdh20Q9Z0M3 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cdh20Q9Z0M3 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cdh20Q9Z0M3 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cdh20Q9Z0M3 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cdh20Q9Z0M3 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cdh20Q9Z0M3 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Cdh20Q9Z0M3 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cdh20Q9Z0M3 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cdh20Q9Z0M3 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cdh20Q9Z0M3 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cdh20Q9Z0M3 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cdh20Q9Z0M3 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cdh20Q9Z0M3 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cdh20Q9Z0M3 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cdh20Q9Z0M3 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Cdh20Q9Z0M3 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cdh20Q9Z0M3 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cdh20Q9Z0M3 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cdh20Q9Z0M3 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cdh20Q9Z0M3 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cdh20Q9Z0M3 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cdh20Q9Z0M3 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cdh20Q9Z0M3 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cdh20Q9Z0M3 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cdh20Q9Z0M3 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cdh20Q9Z0M3 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
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