Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0L3

Oc90, Otoconin-90, mousemouse

Predictions only

Length 485 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Oc90Q9Z0L3 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Oc90Q9Z0L3 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Oc90Q9Z0L3 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Oc90Q9Z0L3 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Oc90Q9Z0L3 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Oc90Q9Z0L3 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Oc90Q9Z0L3 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Oc90Q9Z0L3 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Oc90Q9Z0L3 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Oc90Q9Z0L3 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Oc90Q9Z0L3 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Oc90Q9Z0L3 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Oc90Q9Z0L3 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Oc90Q9Z0L3 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Oc90Q9Z0L3 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Oc90Q9Z0L3 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Oc90Q9Z0L3 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Oc90Q9Z0L3 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Oc90Q9Z0L3 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Oc90Q9Z0L3 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Oc90Q9Z0L3 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Oc90Q9Z0L3 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Oc90Q9Z0L3 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Oc90Q9Z0L3 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Oc90Q9Z0L3 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Oc90Q9Z0L3 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Oc90Q9Z0L3 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Oc90Q9Z0L3 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Oc90Q9Z0L3 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Oc90Q9Z0L3 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Oc90Q9Z0L3 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Oc90Q9Z0L3 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Oc90Q9Z0L3 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Oc90Q9Z0L3 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Oc90Q9Z0L3 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Oc90Q9Z0L3 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Oc90Q9Z0L3 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Oc90Q9Z0L3 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Oc90Q9Z0L3 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Oc90Q9Z0L3 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Oc90Q9Z0L3 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Oc90Q9Z0L3 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Oc90Q9Z0L3 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Oc90Q9Z0L3 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Oc90Q9Z0L3 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Oc90Q9Z0L3 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Oc90Q9Z0L3 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Oc90Q9Z0L3 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Oc90Q9Z0L3 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Oc90Q9Z0L3 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Oc90Q9Z0L3 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Oc90Q9Z0L3 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Oc90Q9Z0L3 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Oc90Q9Z0L3 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Oc90Q9Z0L3 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Oc90Q9Z0L3 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Oc90Q9Z0L3 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Oc90Q9Z0L3 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Oc90Q9Z0L3 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Oc90Q9Z0L3 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Oc90Q9Z0L3 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Oc90Q9Z0L3 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Oc90Q9Z0L3 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Oc90Q9Z0L3 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Oc90Q9Z0L3 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Oc90Q9Z0L3 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Oc90Q9Z0L3 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Oc90Q9Z0L3 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Oc90Q9Z0L3 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Oc90Q9Z0L3 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Oc90Q9Z0L3 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Oc90Q9Z0L3 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Oc90Q9Z0L3 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Oc90Q9Z0L3 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Oc90Q9Z0L3 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Oc90Q9Z0L3 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Oc90Q9Z0L3 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Oc90Q9Z0L3 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Oc90Q9Z0L3 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Oc90Q9Z0L3 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Oc90Q9Z0L3 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Oc90Q9Z0L3 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Oc90Q9Z0L3 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Oc90Q9Z0L3 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Oc90Q9Z0L3 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Oc90Q9Z0L3 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Oc90Q9Z0L3 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Oc90Q9Z0L3 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Oc90Q9Z0L3 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Oc90Q9Z0L3 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Oc90Q9Z0L3 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Oc90Q9Z0L3 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Oc90Q9Z0L3 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Oc90Q9Z0L3 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Oc90Q9Z0L3 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Oc90Q9Z0L3 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Oc90Q9Z0L3 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Oc90Q9Z0L3 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Oc90Q9Z0L3 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Oc90Q9Z0L3 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.1 ms