Protein–RNA interactions for Protein: Q9WV35

Apobec2, C->U-editing enzyme APOBEC-2, mousemouse

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apobec2Q9WV35 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Apobec2Q9WV35 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Apobec2Q9WV35 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Apobec2Q9WV35 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Apobec2Q9WV35 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Apobec2Q9WV35 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Apobec2Q9WV35 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Apobec2Q9WV35 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Apobec2Q9WV35 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Apobec2Q9WV35 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Apobec2Q9WV35 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Apobec2Q9WV35 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Apobec2Q9WV35 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Apobec2Q9WV35 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Apobec2Q9WV35 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Apobec2Q9WV35 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Apobec2Q9WV35 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Apobec2Q9WV35 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Apobec2Q9WV35 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Apobec2Q9WV35 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Apobec2Q9WV35 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Apobec2Q9WV35 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Apobec2Q9WV35 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Apobec2Q9WV35 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Apobec2Q9WV35 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Apobec2Q9WV35 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Apobec2Q9WV35 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Apobec2Q9WV35 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Apobec2Q9WV35 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Apobec2Q9WV35 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Apobec2Q9WV35 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Apobec2Q9WV35 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Apobec2Q9WV35 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Apobec2Q9WV35 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Apobec2Q9WV35 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Apobec2Q9WV35 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Apobec2Q9WV35 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Apobec2Q9WV35 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Apobec2Q9WV35 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Apobec2Q9WV35 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Apobec2Q9WV35 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Apobec2Q9WV35 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Apobec2Q9WV35 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Apobec2Q9WV35 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Apobec2Q9WV35 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Apobec2Q9WV35 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Apobec2Q9WV35 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Apobec2Q9WV35 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Apobec2Q9WV35 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Apobec2Q9WV35 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Apobec2Q9WV35 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Apobec2Q9WV35 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Apobec2Q9WV35 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Apobec2Q9WV35 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Apobec2Q9WV35 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Apobec2Q9WV35 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Apobec2Q9WV35 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Apobec2Q9WV35 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Apobec2Q9WV35 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Apobec2Q9WV35 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Apobec2Q9WV35 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Apobec2Q9WV35 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Apobec2Q9WV35 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Apobec2Q9WV35 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Apobec2Q9WV35 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Apobec2Q9WV35 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Apobec2Q9WV35 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Apobec2Q9WV35 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Apobec2Q9WV35 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Apobec2Q9WV35 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Apobec2Q9WV35 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Apobec2Q9WV35 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Apobec2Q9WV35 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Apobec2Q9WV35 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Apobec2Q9WV35 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Apobec2Q9WV35 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Apobec2Q9WV35 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Apobec2Q9WV35 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Apobec2Q9WV35 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Apobec2Q9WV35 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Apobec2Q9WV35 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Apobec2Q9WV35 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Apobec2Q9WV35 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Apobec2Q9WV35 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Apobec2Q9WV35 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Apobec2Q9WV35 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Apobec2Q9WV35 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Apobec2Q9WV35 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Apobec2Q9WV35 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Apobec2Q9WV35 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Apobec2Q9WV35 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Apobec2Q9WV35 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Apobec2Q9WV35 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Apobec2Q9WV35 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Apobec2Q9WV35 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Apobec2Q9WV35 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Apobec2Q9WV35 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Apobec2Q9WV35 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Apobec2Q9WV35 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Apobec2Q9WV35 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.5 ms