Protein–RNA interactions for Protein: Q9WUD1

Stub1, STIP1 homology and U box-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 304 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stub1Q9WUD1 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Stub1Q9WUD1 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Stub1Q9WUD1 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Stub1Q9WUD1 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Stub1Q9WUD1 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Stub1Q9WUD1 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Stub1Q9WUD1 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Stub1Q9WUD1 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Stub1Q9WUD1 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Stub1Q9WUD1 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Stub1Q9WUD1 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Stub1Q9WUD1 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Stub1Q9WUD1 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Stub1Q9WUD1 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Stub1Q9WUD1 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Stub1Q9WUD1 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Stub1Q9WUD1 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Stub1Q9WUD1 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Stub1Q9WUD1 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Stub1Q9WUD1 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Stub1Q9WUD1 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Stub1Q9WUD1 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Stub1Q9WUD1 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Stub1Q9WUD1 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Stub1Q9WUD1 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Stub1Q9WUD1 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Stub1Q9WUD1 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Stub1Q9WUD1 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Stub1Q9WUD1 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Stub1Q9WUD1 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Stub1Q9WUD1 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Stub1Q9WUD1 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Stub1Q9WUD1 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Stub1Q9WUD1 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Stub1Q9WUD1 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Stub1Q9WUD1 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Stub1Q9WUD1 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Stub1Q9WUD1 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Stub1Q9WUD1 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Stub1Q9WUD1 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Stub1Q9WUD1 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Stub1Q9WUD1 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Stub1Q9WUD1 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Stub1Q9WUD1 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Stub1Q9WUD1 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Stub1Q9WUD1 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Stub1Q9WUD1 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Stub1Q9WUD1 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Stub1Q9WUD1 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Stub1Q9WUD1 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Stub1Q9WUD1 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Stub1Q9WUD1 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Stub1Q9WUD1 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Stub1Q9WUD1 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Stub1Q9WUD1 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Stub1Q9WUD1 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Stub1Q9WUD1 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Stub1Q9WUD1 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Stub1Q9WUD1 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Stub1Q9WUD1 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Stub1Q9WUD1 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Stub1Q9WUD1 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Stub1Q9WUD1 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Stub1Q9WUD1 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Stub1Q9WUD1 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Stub1Q9WUD1 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Stub1Q9WUD1 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Stub1Q9WUD1 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Stub1Q9WUD1 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Stub1Q9WUD1 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Stub1Q9WUD1 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Stub1Q9WUD1 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Stub1Q9WUD1 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Stub1Q9WUD1 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Stub1Q9WUD1 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Stub1Q9WUD1 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Stub1Q9WUD1 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Stub1Q9WUD1 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Stub1Q9WUD1 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Stub1Q9WUD1 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Stub1Q9WUD1 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Stub1Q9WUD1 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Stub1Q9WUD1 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Stub1Q9WUD1 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Stub1Q9WUD1 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Stub1Q9WUD1 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Stub1Q9WUD1 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Stub1Q9WUD1 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Stub1Q9WUD1 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Stub1Q9WUD1 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Stub1Q9WUD1 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Stub1Q9WUD1 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Stub1Q9WUD1 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Stub1Q9WUD1 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Stub1Q9WUD1 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Stub1Q9WUD1 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Stub1Q9WUD1 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Stub1Q9WUD1 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Stub1Q9WUD1 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Stub1Q9WUD1 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.2 ms