Protein–RNA interactions for Protein: Q9WU22

Ptpn4, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 4, mousemouse

Predictions only

Length 926 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptpn4Q9WU22 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ptpn4Q9WU22 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ptpn4Q9WU22 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ptpn4Q9WU22 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ptpn4Q9WU22 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ptpn4Q9WU22 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ptpn4Q9WU22 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ptpn4Q9WU22 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ptpn4Q9WU22 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ptpn4Q9WU22 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ptpn4Q9WU22 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ptpn4Q9WU22 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ptpn4Q9WU22 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ptpn4Q9WU22 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ptpn4Q9WU22 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ptpn4Q9WU22 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ptpn4Q9WU22 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Ptpn4Q9WU22 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ptpn4Q9WU22 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ptpn4Q9WU22 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ptpn4Q9WU22 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ptpn4Q9WU22 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ptpn4Q9WU22 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Ptpn4Q9WU22 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Ptpn4Q9WU22 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Ptpn4Q9WU22 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Ptpn4Q9WU22 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Ptpn4Q9WU22 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Ptpn4Q9WU22 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Ptpn4Q9WU22 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Ptpn4Q9WU22 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ptpn4Q9WU22 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ptpn4Q9WU22 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ptpn4Q9WU22 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ptpn4Q9WU22 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ptpn4Q9WU22 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ptpn4Q9WU22 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ptpn4Q9WU22 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Ptpn4Q9WU22 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ptpn4Q9WU22 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ptpn4Q9WU22 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ptpn4Q9WU22 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ptpn4Q9WU22 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ptpn4Q9WU22 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ptpn4Q9WU22 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ptpn4Q9WU22 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ptpn4Q9WU22 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ptpn4Q9WU22 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ptpn4Q9WU22 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ptpn4Q9WU22 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ptpn4Q9WU22 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC17■□□□□ 0.31
Ptpn4Q9WU22 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
Ptpn4Q9WU22 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
Ptpn4Q9WU22 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Ptpn4Q9WU22 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Ptpn4Q9WU22 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ptpn4Q9WU22 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ptpn4Q9WU22 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ptpn4Q9WU22 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Ptpn4Q9WU22 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ptpn4Q9WU22 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ptpn4Q9WU22 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ptpn4Q9WU22 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ptpn4Q9WU22 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ptpn4Q9WU22 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ptpn4Q9WU22 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ptpn4Q9WU22 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ptpn4Q9WU22 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ptpn4Q9WU22 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ptpn4Q9WU22 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ptpn4Q9WU22 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ptpn4Q9WU22 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ptpn4Q9WU22 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ptpn4Q9WU22 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Ptpn4Q9WU22 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ptpn4Q9WU22 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ptpn4Q9WU22 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ptpn4Q9WU22 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ptpn4Q9WU22 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ptpn4Q9WU22 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ptpn4Q9WU22 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ptpn4Q9WU22 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ptpn4Q9WU22 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ptpn4Q9WU22 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ptpn4Q9WU22 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ptpn4Q9WU22 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ptpn4Q9WU22 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ptpn4Q9WU22 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ptpn4Q9WU22 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ptpn4Q9WU22 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ptpn4Q9WU22 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ptpn4Q9WU22 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ptpn4Q9WU22 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ptpn4Q9WU22 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ptpn4Q9WU22 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ptpn4Q9WU22 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ptpn4Q9WU22 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ptpn4Q9WU22 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ptpn4Q9WU22 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ptpn4Q9WU22 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.2 ms