Protein–RNA interactions for Protein: Q9WTX5

Skp1, S-phase kinase-associated protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 163 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Skp1Q9WTX5 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Skp1Q9WTX5 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Skp1Q9WTX5 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Skp1Q9WTX5 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Skp1Q9WTX5 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Skp1Q9WTX5 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Skp1Q9WTX5 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Skp1Q9WTX5 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Skp1Q9WTX5 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Skp1Q9WTX5 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Skp1Q9WTX5 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Skp1Q9WTX5 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Skp1Q9WTX5 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Skp1Q9WTX5 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Skp1Q9WTX5 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Skp1Q9WTX5 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Skp1Q9WTX5 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Skp1Q9WTX5 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Skp1Q9WTX5 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Skp1Q9WTX5 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Skp1Q9WTX5 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Skp1Q9WTX5 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Skp1Q9WTX5 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Skp1Q9WTX5 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Skp1Q9WTX5 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Skp1Q9WTX5 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Skp1Q9WTX5 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Skp1Q9WTX5 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Skp1Q9WTX5 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Skp1Q9WTX5 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Skp1Q9WTX5 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Skp1Q9WTX5 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Skp1Q9WTX5 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Skp1Q9WTX5 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Skp1Q9WTX5 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Skp1Q9WTX5 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Skp1Q9WTX5 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Skp1Q9WTX5 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Skp1Q9WTX5 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Skp1Q9WTX5 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Skp1Q9WTX5 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Skp1Q9WTX5 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Skp1Q9WTX5 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Skp1Q9WTX5 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Skp1Q9WTX5 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Skp1Q9WTX5 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Skp1Q9WTX5 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Skp1Q9WTX5 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Skp1Q9WTX5 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Skp1Q9WTX5 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Skp1Q9WTX5 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Skp1Q9WTX5 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Skp1Q9WTX5 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Skp1Q9WTX5 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Skp1Q9WTX5 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Skp1Q9WTX5 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Skp1Q9WTX5 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Skp1Q9WTX5 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Skp1Q9WTX5 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Skp1Q9WTX5 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Skp1Q9WTX5 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Skp1Q9WTX5 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Skp1Q9WTX5 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Skp1Q9WTX5 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Skp1Q9WTX5 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Skp1Q9WTX5 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Skp1Q9WTX5 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Skp1Q9WTX5 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Skp1Q9WTX5 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Skp1Q9WTX5 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Skp1Q9WTX5 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Skp1Q9WTX5 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Skp1Q9WTX5 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Skp1Q9WTX5 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Skp1Q9WTX5 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Skp1Q9WTX5 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Skp1Q9WTX5 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Skp1Q9WTX5 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Skp1Q9WTX5 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Skp1Q9WTX5 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Skp1Q9WTX5 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Skp1Q9WTX5 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Skp1Q9WTX5 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Skp1Q9WTX5 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Skp1Q9WTX5 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Skp1Q9WTX5 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Skp1Q9WTX5 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Skp1Q9WTX5 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Skp1Q9WTX5 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Skp1Q9WTX5 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Skp1Q9WTX5 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Skp1Q9WTX5 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Skp1Q9WTX5 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Skp1Q9WTX5 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Skp1Q9WTX5 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Skp1Q9WTX5 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Skp1Q9WTX5 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Skp1Q9WTX5 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Skp1Q9WTX5 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Skp1Q9WTX5 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms