Protein–RNA interactions for Protein: Q9WTX2

Prkra, Interferon-inducible double-stranded RNA-dependent protein kinase activator A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 313 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkraQ9WTX2 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PrkraQ9WTX2 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PrkraQ9WTX2 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PrkraQ9WTX2 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
PrkraQ9WTX2 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PrkraQ9WTX2 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
PrkraQ9WTX2 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
PrkraQ9WTX2 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
PrkraQ9WTX2 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
PrkraQ9WTX2 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PrkraQ9WTX2 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PrkraQ9WTX2 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
PrkraQ9WTX2 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
PrkraQ9WTX2 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
PrkraQ9WTX2 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
PrkraQ9WTX2 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
PrkraQ9WTX2 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
PrkraQ9WTX2 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
PrkraQ9WTX2 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PrkraQ9WTX2 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PrkraQ9WTX2 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PrkraQ9WTX2 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PrkraQ9WTX2 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PrkraQ9WTX2 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PrkraQ9WTX2 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PrkraQ9WTX2 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PrkraQ9WTX2 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PrkraQ9WTX2 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PrkraQ9WTX2 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
PrkraQ9WTX2 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PrkraQ9WTX2 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PrkraQ9WTX2 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PrkraQ9WTX2 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PrkraQ9WTX2 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PrkraQ9WTX2 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PrkraQ9WTX2 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PrkraQ9WTX2 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PrkraQ9WTX2 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PrkraQ9WTX2 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PrkraQ9WTX2 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PrkraQ9WTX2 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PrkraQ9WTX2 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PrkraQ9WTX2 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PrkraQ9WTX2 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PrkraQ9WTX2 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
PrkraQ9WTX2 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PrkraQ9WTX2 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PrkraQ9WTX2 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PrkraQ9WTX2 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PrkraQ9WTX2 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PrkraQ9WTX2 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PrkraQ9WTX2 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PrkraQ9WTX2 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PrkraQ9WTX2 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PrkraQ9WTX2 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
PrkraQ9WTX2 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PrkraQ9WTX2 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PrkraQ9WTX2 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PrkraQ9WTX2 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PrkraQ9WTX2 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PrkraQ9WTX2 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PrkraQ9WTX2 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PrkraQ9WTX2 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PrkraQ9WTX2 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PrkraQ9WTX2 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PrkraQ9WTX2 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
PrkraQ9WTX2 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PrkraQ9WTX2 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PrkraQ9WTX2 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PrkraQ9WTX2 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PrkraQ9WTX2 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PrkraQ9WTX2 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PrkraQ9WTX2 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PrkraQ9WTX2 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PrkraQ9WTX2 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PrkraQ9WTX2 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PrkraQ9WTX2 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PrkraQ9WTX2 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PrkraQ9WTX2 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PrkraQ9WTX2 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PrkraQ9WTX2 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PrkraQ9WTX2 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PrkraQ9WTX2 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PrkraQ9WTX2 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PrkraQ9WTX2 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PrkraQ9WTX2 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PrkraQ9WTX2 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PrkraQ9WTX2 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PrkraQ9WTX2 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PrkraQ9WTX2 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PrkraQ9WTX2 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PrkraQ9WTX2 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PrkraQ9WTX2 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PrkraQ9WTX2 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PrkraQ9WTX2 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PrkraQ9WTX2 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PrkraQ9WTX2 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
PrkraQ9WTX2 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PrkraQ9WTX2 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PrkraQ9WTX2 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.3 ms