Protein–RNA interactions for Protein: Q9WTV6

Usp18, Ubl carboxyl-terminal hydrolase 18, mousemouse

Predictions only

Length 368 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp18Q9WTV6 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
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Usp18Q9WTV6 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Usp18Q9WTV6 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Usp18Q9WTV6 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Usp18Q9WTV6 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
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Usp18Q9WTV6 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Usp18Q9WTV6 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Usp18Q9WTV6 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Usp18Q9WTV6 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
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Usp18Q9WTV6 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
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Usp18Q9WTV6 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Usp18Q9WTV6 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
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Usp18Q9WTV6 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
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Usp18Q9WTV6 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
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Usp18Q9WTV6 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
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Usp18Q9WTV6 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Usp18Q9WTV6 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Usp18Q9WTV6 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Usp18Q9WTV6 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Usp18Q9WTV6 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Usp18Q9WTV6 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Usp18Q9WTV6 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
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Usp18Q9WTV6 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Usp18Q9WTV6 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Usp18Q9WTV6 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Usp18Q9WTV6 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Usp18Q9WTV6 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Usp18Q9WTV6 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Usp18Q9WTV6 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
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Usp18Q9WTV6 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
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