Protein–RNA interactions for Protein: Q9WTJ8

Fam50b, Protein FAM50B, mousemouse

Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam50bQ9WTJ8 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Fam50bQ9WTJ8 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Fam50bQ9WTJ8 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Fam50bQ9WTJ8 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Fam50bQ9WTJ8 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Fam50bQ9WTJ8 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Fam50bQ9WTJ8 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Fam50bQ9WTJ8 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Fam50bQ9WTJ8 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Fam50bQ9WTJ8 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Fam50bQ9WTJ8 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Fam50bQ9WTJ8 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Fam50bQ9WTJ8 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Fam50bQ9WTJ8 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Fam50bQ9WTJ8 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Fam50bQ9WTJ8 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Fam50bQ9WTJ8 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Fam50bQ9WTJ8 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Fam50bQ9WTJ8 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Fam50bQ9WTJ8 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Fam50bQ9WTJ8 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Fam50bQ9WTJ8 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Fam50bQ9WTJ8 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Fam50bQ9WTJ8 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Fam50bQ9WTJ8 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Fam50bQ9WTJ8 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Fam50bQ9WTJ8 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Fam50bQ9WTJ8 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Fam50bQ9WTJ8 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Fam50bQ9WTJ8 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Fam50bQ9WTJ8 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Fam50bQ9WTJ8 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Fam50bQ9WTJ8 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Fam50bQ9WTJ8 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Fam50bQ9WTJ8 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Fam50bQ9WTJ8 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Fam50bQ9WTJ8 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Fam50bQ9WTJ8 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Fam50bQ9WTJ8 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Fam50bQ9WTJ8 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Fam50bQ9WTJ8 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Fam50bQ9WTJ8 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Fam50bQ9WTJ8 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Fam50bQ9WTJ8 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Fam50bQ9WTJ8 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Fam50bQ9WTJ8 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Fam50bQ9WTJ8 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Fam50bQ9WTJ8 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Fam50bQ9WTJ8 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Fam50bQ9WTJ8 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Fam50bQ9WTJ8 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Fam50bQ9WTJ8 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Fam50bQ9WTJ8 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Fam50bQ9WTJ8 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Fam50bQ9WTJ8 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Fam50bQ9WTJ8 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Fam50bQ9WTJ8 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Fam50bQ9WTJ8 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Fam50bQ9WTJ8 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Fam50bQ9WTJ8 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Fam50bQ9WTJ8 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Fam50bQ9WTJ8 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Fam50bQ9WTJ8 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Fam50bQ9WTJ8 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Fam50bQ9WTJ8 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Fam50bQ9WTJ8 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Fam50bQ9WTJ8 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Fam50bQ9WTJ8 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Fam50bQ9WTJ8 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Fam50bQ9WTJ8 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Fam50bQ9WTJ8 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Fam50bQ9WTJ8 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Fam50bQ9WTJ8 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Fam50bQ9WTJ8 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Fam50bQ9WTJ8 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Fam50bQ9WTJ8 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Fam50bQ9WTJ8 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Fam50bQ9WTJ8 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Fam50bQ9WTJ8 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Fam50bQ9WTJ8 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Fam50bQ9WTJ8 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Fam50bQ9WTJ8 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Fam50bQ9WTJ8 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Fam50bQ9WTJ8 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Fam50bQ9WTJ8 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Fam50bQ9WTJ8 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Fam50bQ9WTJ8 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Fam50bQ9WTJ8 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Fam50bQ9WTJ8 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Fam50bQ9WTJ8 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Fam50bQ9WTJ8 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Fam50bQ9WTJ8 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Fam50bQ9WTJ8 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Fam50bQ9WTJ8 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Fam50bQ9WTJ8 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Fam50bQ9WTJ8 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Fam50bQ9WTJ8 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Fam50bQ9WTJ8 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Fam50bQ9WTJ8 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Fam50bQ9WTJ8 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 85.4 ms