Protein–RNA interactions for Protein: Q9R1W3

Rnf103, E3 ubiquitin-protein ligase RNF103, mousemouse

Predictions only

Length 683 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf103Q9R1W3 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rnf103Q9R1W3 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rnf103Q9R1W3 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rnf103Q9R1W3 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rnf103Q9R1W3 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rnf103Q9R1W3 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rnf103Q9R1W3 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rnf103Q9R1W3 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rnf103Q9R1W3 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rnf103Q9R1W3 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rnf103Q9R1W3 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rnf103Q9R1W3 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rnf103Q9R1W3 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rnf103Q9R1W3 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rnf103Q9R1W3 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rnf103Q9R1W3 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rnf103Q9R1W3 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rnf103Q9R1W3 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rnf103Q9R1W3 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rnf103Q9R1W3 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rnf103Q9R1W3 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rnf103Q9R1W3 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rnf103Q9R1W3 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rnf103Q9R1W3 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rnf103Q9R1W3 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rnf103Q9R1W3 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rnf103Q9R1W3 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rnf103Q9R1W3 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rnf103Q9R1W3 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rnf103Q9R1W3 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rnf103Q9R1W3 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rnf103Q9R1W3 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rnf103Q9R1W3 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rnf103Q9R1W3 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rnf103Q9R1W3 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rnf103Q9R1W3 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rnf103Q9R1W3 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rnf103Q9R1W3 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rnf103Q9R1W3 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rnf103Q9R1W3 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rnf103Q9R1W3 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rnf103Q9R1W3 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rnf103Q9R1W3 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rnf103Q9R1W3 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rnf103Q9R1W3 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rnf103Q9R1W3 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rnf103Q9R1W3 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rnf103Q9R1W3 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rnf103Q9R1W3 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rnf103Q9R1W3 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rnf103Q9R1W3 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Rnf103Q9R1W3 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rnf103Q9R1W3 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rnf103Q9R1W3 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rnf103Q9R1W3 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rnf103Q9R1W3 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rnf103Q9R1W3 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rnf103Q9R1W3 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rnf103Q9R1W3 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rnf103Q9R1W3 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rnf103Q9R1W3 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rnf103Q9R1W3 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rnf103Q9R1W3 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rnf103Q9R1W3 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rnf103Q9R1W3 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rnf103Q9R1W3 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rnf103Q9R1W3 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rnf103Q9R1W3 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rnf103Q9R1W3 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rnf103Q9R1W3 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rnf103Q9R1W3 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rnf103Q9R1W3 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rnf103Q9R1W3 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Rnf103Q9R1W3 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rnf103Q9R1W3 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rnf103Q9R1W3 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rnf103Q9R1W3 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rnf103Q9R1W3 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rnf103Q9R1W3 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rnf103Q9R1W3 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rnf103Q9R1W3 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rnf103Q9R1W3 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rnf103Q9R1W3 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rnf103Q9R1W3 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rnf103Q9R1W3 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rnf103Q9R1W3 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rnf103Q9R1W3 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Rnf103Q9R1W3 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rnf103Q9R1W3 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rnf103Q9R1W3 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rnf103Q9R1W3 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rnf103Q9R1W3 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rnf103Q9R1W3 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rnf103Q9R1W3 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rnf103Q9R1W3 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rnf103Q9R1W3 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rnf103Q9R1W3 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rnf103Q9R1W3 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rnf103Q9R1W3 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rnf103Q9R1W3 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.6 ms