Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0Q3

Tmed2, Transmembrane emp24 domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmed2Q9R0Q3 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tmed2Q9R0Q3 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tmed2Q9R0Q3 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tmed2Q9R0Q3 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tmed2Q9R0Q3 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tmed2Q9R0Q3 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tmed2Q9R0Q3 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tmed2Q9R0Q3 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tmed2Q9R0Q3 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tmed2Q9R0Q3 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tmed2Q9R0Q3 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tmed2Q9R0Q3 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tmed2Q9R0Q3 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tmed2Q9R0Q3 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tmed2Q9R0Q3 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tmed2Q9R0Q3 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tmed2Q9R0Q3 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tmed2Q9R0Q3 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tmed2Q9R0Q3 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tmed2Q9R0Q3 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tmed2Q9R0Q3 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tmed2Q9R0Q3 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tmed2Q9R0Q3 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tmed2Q9R0Q3 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tmed2Q9R0Q3 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tmed2Q9R0Q3 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tmed2Q9R0Q3 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tmed2Q9R0Q3 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tmed2Q9R0Q3 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tmed2Q9R0Q3 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tmed2Q9R0Q3 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tmed2Q9R0Q3 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tmed2Q9R0Q3 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tmed2Q9R0Q3 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tmed2Q9R0Q3 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Tmed2Q9R0Q3 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tmed2Q9R0Q3 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tmed2Q9R0Q3 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tmed2Q9R0Q3 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tmed2Q9R0Q3 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tmed2Q9R0Q3 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tmed2Q9R0Q3 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tmed2Q9R0Q3 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tmed2Q9R0Q3 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tmed2Q9R0Q3 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Tmed2Q9R0Q3 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
Tmed2Q9R0Q3 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Tmed2Q9R0Q3 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Tmed2Q9R0Q3 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Tmed2Q9R0Q3 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Tmed2Q9R0Q3 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Tmed2Q9R0Q3 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Tmed2Q9R0Q3 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Tmed2Q9R0Q3 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Tmed2Q9R0Q3 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Tmed2Q9R0Q3 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Tmed2Q9R0Q3 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Tmed2Q9R0Q3 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Tmed2Q9R0Q3 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Tmed2Q9R0Q3 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Tmed2Q9R0Q3 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Tmed2Q9R0Q3 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Tmed2Q9R0Q3 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Tmed2Q9R0Q3 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Tmed2Q9R0Q3 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Tmed2Q9R0Q3 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Tmed2Q9R0Q3 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Tmed2Q9R0Q3 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Tmed2Q9R0Q3 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Tmed2Q9R0Q3 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tmed2Q9R0Q3 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tmed2Q9R0Q3 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tmed2Q9R0Q3 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tmed2Q9R0Q3 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tmed2Q9R0Q3 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tmed2Q9R0Q3 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tmed2Q9R0Q3 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Tmed2Q9R0Q3 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tmed2Q9R0Q3 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tmed2Q9R0Q3 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Tmed2Q9R0Q3 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tmed2Q9R0Q3 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tmed2Q9R0Q3 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tmed2Q9R0Q3 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tmed2Q9R0Q3 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tmed2Q9R0Q3 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tmed2Q9R0Q3 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tmed2Q9R0Q3 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tmed2Q9R0Q3 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tmed2Q9R0Q3 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tmed2Q9R0Q3 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tmed2Q9R0Q3 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tmed2Q9R0Q3 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tmed2Q9R0Q3 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tmed2Q9R0Q3 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tmed2Q9R0Q3 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tmed2Q9R0Q3 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tmed2Q9R0Q3 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tmed2Q9R0Q3 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tmed2Q9R0Q3 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms