Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0Q1

Sytl4, Synaptotagmin-like protein 4, mousemouse

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Length 673 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sytl4Q9R0Q1 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Sytl4Q9R0Q1 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Sytl4Q9R0Q1 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Sytl4Q9R0Q1 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Sytl4Q9R0Q1 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Sytl4Q9R0Q1 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Sytl4Q9R0Q1 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Sytl4Q9R0Q1 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Sytl4Q9R0Q1 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Sytl4Q9R0Q1 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Sytl4Q9R0Q1 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Sytl4Q9R0Q1 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Sytl4Q9R0Q1 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Sytl4Q9R0Q1 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Sytl4Q9R0Q1 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Sytl4Q9R0Q1 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Sytl4Q9R0Q1 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Sytl4Q9R0Q1 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Sytl4Q9R0Q1 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Sytl4Q9R0Q1 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Sytl4Q9R0Q1 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Sytl4Q9R0Q1 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Sytl4Q9R0Q1 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Sytl4Q9R0Q1 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Sytl4Q9R0Q1 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Sytl4Q9R0Q1 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Sytl4Q9R0Q1 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Sytl4Q9R0Q1 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Sytl4Q9R0Q1 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Sytl4Q9R0Q1 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Sytl4Q9R0Q1 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Sytl4Q9R0Q1 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Sytl4Q9R0Q1 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Sytl4Q9R0Q1 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Sytl4Q9R0Q1 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
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Sytl4Q9R0Q1 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Sytl4Q9R0Q1 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
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Sytl4Q9R0Q1 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
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Sytl4Q9R0Q1 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
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Sytl4Q9R0Q1 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Sytl4Q9R0Q1 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Sytl4Q9R0Q1 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Sytl4Q9R0Q1 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Sytl4Q9R0Q1 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
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Sytl4Q9R0Q1 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
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Sytl4Q9R0Q1 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Sytl4Q9R0Q1 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
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Sytl4Q9R0Q1 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
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Sytl4Q9R0Q1 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Sytl4Q9R0Q1 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
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Sytl4Q9R0Q1 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Sytl4Q9R0Q1 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Sytl4Q9R0Q1 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Sytl4Q9R0Q1 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
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Sytl4Q9R0Q1 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Sytl4Q9R0Q1 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Sytl4Q9R0Q1 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Sytl4Q9R0Q1 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Sytl4Q9R0Q1 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Sytl4Q9R0Q1 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Sytl4Q9R0Q1 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Sytl4Q9R0Q1 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Sytl4Q9R0Q1 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Sytl4Q9R0Q1 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Sytl4Q9R0Q1 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Sytl4Q9R0Q1 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Sytl4Q9R0Q1 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Sytl4Q9R0Q1 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Sytl4Q9R0Q1 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Sytl4Q9R0Q1 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Sytl4Q9R0Q1 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.3 ms