Protein–RNA interactions for Protein: Q9R060

Nubp1, Cytosolic Fe-S cluster assembly factor NUBP1, mousemouse

Predictions only

Length 320 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nubp1Q9R060 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Nubp1Q9R060 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Nubp1Q9R060 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nubp1Q9R060 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nubp1Q9R060 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nubp1Q9R060 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nubp1Q9R060 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nubp1Q9R060 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nubp1Q9R060 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nubp1Q9R060 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nubp1Q9R060 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nubp1Q9R060 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nubp1Q9R060 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Nubp1Q9R060 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nubp1Q9R060 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Nubp1Q9R060 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Nubp1Q9R060 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Nubp1Q9R060 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Nubp1Q9R060 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nubp1Q9R060 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nubp1Q9R060 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Nubp1Q9R060 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nubp1Q9R060 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nubp1Q9R060 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nubp1Q9R060 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nubp1Q9R060 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Nubp1Q9R060 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nubp1Q9R060 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Nubp1Q9R060 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Nubp1Q9R060 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Nubp1Q9R060 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Nubp1Q9R060 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Nubp1Q9R060 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Nubp1Q9R060 Pid1-205ENSMUST00000176720 450 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Nubp1Q9R060 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Nubp1Q9R060 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Nubp1Q9R060 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Nubp1Q9R060 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Nubp1Q9R060 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Nubp1Q9R060 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Nubp1Q9R060 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Nubp1Q9R060 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Nubp1Q9R060 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Nubp1Q9R060 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Nubp1Q9R060 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Nubp1Q9R060 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Nubp1Q9R060 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nubp1Q9R060 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nubp1Q9R060 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nubp1Q9R060 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nubp1Q9R060 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nubp1Q9R060 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Nubp1Q9R060 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nubp1Q9R060 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nubp1Q9R060 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nubp1Q9R060 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Nubp1Q9R060 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nubp1Q9R060 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nubp1Q9R060 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nubp1Q9R060 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nubp1Q9R060 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nubp1Q9R060 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Nubp1Q9R060 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.04■□□□□ -0
Nubp1Q9R060 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.04■□□□□ -0
Nubp1Q9R060 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.04■□□□□ -0
Nubp1Q9R060 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.04■□□□□ -0
Nubp1Q9R060 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Nubp1Q9R060 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nubp1Q9R060 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nubp1Q9R060 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nubp1Q9R060 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nubp1Q9R060 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nubp1Q9R060 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nubp1Q9R060 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nubp1Q9R060 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nubp1Q9R060 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nubp1Q9R060 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Nubp1Q9R060 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nubp1Q9R060 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nubp1Q9R060 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Nubp1Q9R060 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nubp1Q9R060 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Nubp1Q9R060 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nubp1Q9R060 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Nubp1Q9R060 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Nubp1Q9R060 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Nubp1Q9R060 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nubp1Q9R060 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Nubp1Q9R060 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Nubp1Q9R060 CT009764.1-201ENSMUST00000222260 483 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Nubp1Q9R060 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nubp1Q9R060 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nubp1Q9R060 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nubp1Q9R060 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Nubp1Q9R060 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nubp1Q9R060 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nubp1Q9R060 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nubp1Q9R060 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Nubp1Q9R060 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Nubp1Q9R060 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.1 ms