Protein–RNA interactions for Protein: Q9R049

Amfr, E3 ubiquitin-protein ligase AMFR, mousemouse

Predictions only

Length 643 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AmfrQ9R049 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
AmfrQ9R049 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
AmfrQ9R049 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
AmfrQ9R049 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
AmfrQ9R049 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
AmfrQ9R049 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
AmfrQ9R049 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
AmfrQ9R049 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
AmfrQ9R049 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
AmfrQ9R049 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
AmfrQ9R049 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
AmfrQ9R049 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
AmfrQ9R049 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
AmfrQ9R049 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
AmfrQ9R049 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
AmfrQ9R049 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
AmfrQ9R049 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
AmfrQ9R049 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
AmfrQ9R049 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
AmfrQ9R049 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
AmfrQ9R049 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
AmfrQ9R049 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
AmfrQ9R049 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
AmfrQ9R049 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
AmfrQ9R049 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
AmfrQ9R049 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
AmfrQ9R049 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
AmfrQ9R049 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
AmfrQ9R049 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
AmfrQ9R049 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
AmfrQ9R049 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
AmfrQ9R049 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
AmfrQ9R049 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
AmfrQ9R049 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
AmfrQ9R049 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
AmfrQ9R049 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
AmfrQ9R049 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
AmfrQ9R049 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
AmfrQ9R049 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
AmfrQ9R049 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
AmfrQ9R049 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
AmfrQ9R049 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
AmfrQ9R049 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
AmfrQ9R049 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
AmfrQ9R049 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
AmfrQ9R049 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
AmfrQ9R049 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
AmfrQ9R049 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
AmfrQ9R049 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
AmfrQ9R049 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
AmfrQ9R049 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
AmfrQ9R049 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
AmfrQ9R049 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
AmfrQ9R049 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
AmfrQ9R049 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
AmfrQ9R049 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
AmfrQ9R049 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
AmfrQ9R049 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
AmfrQ9R049 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
AmfrQ9R049 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
AmfrQ9R049 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
AmfrQ9R049 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
AmfrQ9R049 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
AmfrQ9R049 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
AmfrQ9R049 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
AmfrQ9R049 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
AmfrQ9R049 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
AmfrQ9R049 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
AmfrQ9R049 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
AmfrQ9R049 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
AmfrQ9R049 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
AmfrQ9R049 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
AmfrQ9R049 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
AmfrQ9R049 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
AmfrQ9R049 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
AmfrQ9R049 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
AmfrQ9R049 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
AmfrQ9R049 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
AmfrQ9R049 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
AmfrQ9R049 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
AmfrQ9R049 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
AmfrQ9R049 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
AmfrQ9R049 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
AmfrQ9R049 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
AmfrQ9R049 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
AmfrQ9R049 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
AmfrQ9R049 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
AmfrQ9R049 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
AmfrQ9R049 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
AmfrQ9R049 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
AmfrQ9R049 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
AmfrQ9R049 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
AmfrQ9R049 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
AmfrQ9R049 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
AmfrQ9R049 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
AmfrQ9R049 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
AmfrQ9R049 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
AmfrQ9R049 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
AmfrQ9R049 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
AmfrQ9R049 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.2 ms