Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZS0

Col4a3, Collagen alpha-3(IV) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,669 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col4a3Q9QZS0 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Col4a3Q9QZS0 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Col4a3Q9QZS0 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Col4a3Q9QZS0 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Col4a3Q9QZS0 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Col4a3Q9QZS0 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Col4a3Q9QZS0 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Col4a3Q9QZS0 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Col4a3Q9QZS0 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Col4a3Q9QZS0 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Col4a3Q9QZS0 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Col4a3Q9QZS0 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Col4a3Q9QZS0 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Col4a3Q9QZS0 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Col4a3Q9QZS0 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Col4a3Q9QZS0 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Col4a3Q9QZS0 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Col4a3Q9QZS0 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Col4a3Q9QZS0 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Col4a3Q9QZS0 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Col4a3Q9QZS0 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
Col4a3Q9QZS0 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Col4a3Q9QZS0 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Col4a3Q9QZS0 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Col4a3Q9QZS0 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
Col4a3Q9QZS0 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Col4a3Q9QZS0 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Col4a3Q9QZS0 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Col4a3Q9QZS0 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Col4a3Q9QZS0 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Col4a3Q9QZS0 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Col4a3Q9QZS0 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Col4a3Q9QZS0 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Col4a3Q9QZS0 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
Col4a3Q9QZS0 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Col4a3Q9QZS0 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Col4a3Q9QZS0 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Col4a3Q9QZS0 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Col4a3Q9QZS0 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Col4a3Q9QZS0 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Col4a3Q9QZS0 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Col4a3Q9QZS0 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Col4a3Q9QZS0 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Col4a3Q9QZS0 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Col4a3Q9QZS0 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Col4a3Q9QZS0 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Col4a3Q9QZS0 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Col4a3Q9QZS0 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Col4a3Q9QZS0 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Col4a3Q9QZS0 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Col4a3Q9QZS0 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.58
Col4a3Q9QZS0 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Col4a3Q9QZS0 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC18.64■□□□□ 0.58
Col4a3Q9QZS0 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Col4a3Q9QZS0 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Col4a3Q9QZS0 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
Col4a3Q9QZS0 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Col4a3Q9QZS0 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Col4a3Q9QZS0 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Col4a3Q9QZS0 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Col4a3Q9QZS0 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Col4a3Q9QZS0 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Col4a3Q9QZS0 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Col4a3Q9QZS0 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Col4a3Q9QZS0 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Col4a3Q9QZS0 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Col4a3Q9QZS0 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Col4a3Q9QZS0 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Col4a3Q9QZS0 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Col4a3Q9QZS0 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Col4a3Q9QZS0 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Col4a3Q9QZS0 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Col4a3Q9QZS0 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Col4a3Q9QZS0 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Col4a3Q9QZS0 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Col4a3Q9QZS0 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Col4a3Q9QZS0 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Col4a3Q9QZS0 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Col4a3Q9QZS0 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Col4a3Q9QZS0 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Col4a3Q9QZS0 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Col4a3Q9QZS0 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Col4a3Q9QZS0 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Col4a3Q9QZS0 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Col4a3Q9QZS0 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Col4a3Q9QZS0 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Col4a3Q9QZS0 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Col4a3Q9QZS0 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Col4a3Q9QZS0 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Col4a3Q9QZS0 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Col4a3Q9QZS0 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Col4a3Q9QZS0 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Col4a3Q9QZS0 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Col4a3Q9QZS0 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Col4a3Q9QZS0 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Col4a3Q9QZS0 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Col4a3Q9QZS0 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Col4a3Q9QZS0 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Col4a3Q9QZS0 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Col4a3Q9QZS0 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms