Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZQ0

Npas3, Neuronal PAS domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 925 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Npas3Q9QZQ0 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Npas3Q9QZQ0 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Npas3Q9QZQ0 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Npas3Q9QZQ0 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Npas3Q9QZQ0 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Npas3Q9QZQ0 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Npas3Q9QZQ0 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Npas3Q9QZQ0 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Npas3Q9QZQ0 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Npas3Q9QZQ0 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Npas3Q9QZQ0 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Npas3Q9QZQ0 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Npas3Q9QZQ0 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Npas3Q9QZQ0 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Npas3Q9QZQ0 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Npas3Q9QZQ0 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Npas3Q9QZQ0 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Npas3Q9QZQ0 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Npas3Q9QZQ0 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Npas3Q9QZQ0 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Npas3Q9QZQ0 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Npas3Q9QZQ0 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Npas3Q9QZQ0 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Npas3Q9QZQ0 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Npas3Q9QZQ0 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Npas3Q9QZQ0 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Npas3Q9QZQ0 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Npas3Q9QZQ0 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Npas3Q9QZQ0 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Npas3Q9QZQ0 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Npas3Q9QZQ0 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Npas3Q9QZQ0 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Npas3Q9QZQ0 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Npas3Q9QZQ0 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Npas3Q9QZQ0 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Npas3Q9QZQ0 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Npas3Q9QZQ0 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Npas3Q9QZQ0 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Npas3Q9QZQ0 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Npas3Q9QZQ0 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Npas3Q9QZQ0 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Npas3Q9QZQ0 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Npas3Q9QZQ0 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Npas3Q9QZQ0 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Npas3Q9QZQ0 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Npas3Q9QZQ0 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Npas3Q9QZQ0 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Npas3Q9QZQ0 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Npas3Q9QZQ0 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Npas3Q9QZQ0 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Npas3Q9QZQ0 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Npas3Q9QZQ0 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Npas3Q9QZQ0 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Npas3Q9QZQ0 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Npas3Q9QZQ0 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Npas3Q9QZQ0 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Npas3Q9QZQ0 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Npas3Q9QZQ0 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Npas3Q9QZQ0 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Npas3Q9QZQ0 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Npas3Q9QZQ0 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Npas3Q9QZQ0 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Npas3Q9QZQ0 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Npas3Q9QZQ0 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Npas3Q9QZQ0 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Npas3Q9QZQ0 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Npas3Q9QZQ0 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Npas3Q9QZQ0 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Npas3Q9QZQ0 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Npas3Q9QZQ0 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Npas3Q9QZQ0 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Npas3Q9QZQ0 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Npas3Q9QZQ0 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Npas3Q9QZQ0 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Npas3Q9QZQ0 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Npas3Q9QZQ0 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Npas3Q9QZQ0 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Npas3Q9QZQ0 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Npas3Q9QZQ0 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Npas3Q9QZQ0 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Npas3Q9QZQ0 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Npas3Q9QZQ0 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Npas3Q9QZQ0 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Npas3Q9QZQ0 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Npas3Q9QZQ0 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Npas3Q9QZQ0 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Npas3Q9QZQ0 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Npas3Q9QZQ0 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Npas3Q9QZQ0 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Npas3Q9QZQ0 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Npas3Q9QZQ0 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Npas3Q9QZQ0 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Npas3Q9QZQ0 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Npas3Q9QZQ0 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Npas3Q9QZQ0 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Npas3Q9QZQ0 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Npas3Q9QZQ0 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Npas3Q9QZQ0 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Npas3Q9QZQ0 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Npas3Q9QZQ0 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.7 ms