Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZE5

Copg1, Coatomer subunit gamma-1, mousemouse

Predictions only

Length 874 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Copg1Q9QZE5 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Copg1Q9QZE5 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Copg1Q9QZE5 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Copg1Q9QZE5 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Copg1Q9QZE5 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Copg1Q9QZE5 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Copg1Q9QZE5 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Copg1Q9QZE5 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Copg1Q9QZE5 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Copg1Q9QZE5 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Copg1Q9QZE5 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Copg1Q9QZE5 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Copg1Q9QZE5 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Copg1Q9QZE5 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Copg1Q9QZE5 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Copg1Q9QZE5 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Copg1Q9QZE5 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Copg1Q9QZE5 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Copg1Q9QZE5 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Copg1Q9QZE5 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Copg1Q9QZE5 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Copg1Q9QZE5 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Copg1Q9QZE5 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Copg1Q9QZE5 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Copg1Q9QZE5 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Copg1Q9QZE5 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Copg1Q9QZE5 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Copg1Q9QZE5 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Copg1Q9QZE5 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Copg1Q9QZE5 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Copg1Q9QZE5 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Copg1Q9QZE5 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Copg1Q9QZE5 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Copg1Q9QZE5 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Copg1Q9QZE5 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Copg1Q9QZE5 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Copg1Q9QZE5 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Copg1Q9QZE5 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Copg1Q9QZE5 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Copg1Q9QZE5 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Copg1Q9QZE5 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Copg1Q9QZE5 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Copg1Q9QZE5 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Copg1Q9QZE5 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Copg1Q9QZE5 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Copg1Q9QZE5 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Copg1Q9QZE5 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Copg1Q9QZE5 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Copg1Q9QZE5 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Copg1Q9QZE5 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Copg1Q9QZE5 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Copg1Q9QZE5 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Copg1Q9QZE5 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Copg1Q9QZE5 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Copg1Q9QZE5 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Copg1Q9QZE5 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Copg1Q9QZE5 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Copg1Q9QZE5 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Copg1Q9QZE5 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Copg1Q9QZE5 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Copg1Q9QZE5 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Copg1Q9QZE5 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Copg1Q9QZE5 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Copg1Q9QZE5 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Copg1Q9QZE5 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Copg1Q9QZE5 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Copg1Q9QZE5 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Copg1Q9QZE5 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.38
Copg1Q9QZE5 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Copg1Q9QZE5 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Copg1Q9QZE5 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Copg1Q9QZE5 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Copg1Q9QZE5 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Copg1Q9QZE5 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Copg1Q9QZE5 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Copg1Q9QZE5 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Copg1Q9QZE5 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Copg1Q9QZE5 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Copg1Q9QZE5 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Copg1Q9QZE5 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Copg1Q9QZE5 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Copg1Q9QZE5 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Copg1Q9QZE5 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Copg1Q9QZE5 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Copg1Q9QZE5 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Copg1Q9QZE5 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Copg1Q9QZE5 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Copg1Q9QZE5 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Copg1Q9QZE5 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Copg1Q9QZE5 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Copg1Q9QZE5 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Copg1Q9QZE5 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Copg1Q9QZE5 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Copg1Q9QZE5 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Copg1Q9QZE5 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Copg1Q9QZE5 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Copg1Q9QZE5 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Copg1Q9QZE5 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Copg1Q9QZE5 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Copg1Q9QZE5 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.7 ms