Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZ47

Tnnt3, Troponin T, fast skeletal muscle, mousemouse

Predictions only

Length 272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnnt3Q9QZ47 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Tnnt3Q9QZ47 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Tnnt3Q9QZ47 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Tnnt3Q9QZ47 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Tnnt3Q9QZ47 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Tnnt3Q9QZ47 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Tnnt3Q9QZ47 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Tnnt3Q9QZ47 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Tnnt3Q9QZ47 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Tnnt3Q9QZ47 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Tnnt3Q9QZ47 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Tnnt3Q9QZ47 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Tnnt3Q9QZ47 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Tnnt3Q9QZ47 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Tnnt3Q9QZ47 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Tnnt3Q9QZ47 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Tnnt3Q9QZ47 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Tnnt3Q9QZ47 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Tnnt3Q9QZ47 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Tnnt3Q9QZ47 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Tnnt3Q9QZ47 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Tnnt3Q9QZ47 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Tnnt3Q9QZ47 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Tnnt3Q9QZ47 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Tnnt3Q9QZ47 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Tnnt3Q9QZ47 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Tnnt3Q9QZ47 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Tnnt3Q9QZ47 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Tnnt3Q9QZ47 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Tnnt3Q9QZ47 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Tnnt3Q9QZ47 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Tnnt3Q9QZ47 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Tnnt3Q9QZ47 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Tnnt3Q9QZ47 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Tnnt3Q9QZ47 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Tnnt3Q9QZ47 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Tnnt3Q9QZ47 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Tnnt3Q9QZ47 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Tnnt3Q9QZ47 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Tnnt3Q9QZ47 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Tnnt3Q9QZ47 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Tnnt3Q9QZ47 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Tnnt3Q9QZ47 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Tnnt3Q9QZ47 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Tnnt3Q9QZ47 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Tnnt3Q9QZ47 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Tnnt3Q9QZ47 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Tnnt3Q9QZ47 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Tnnt3Q9QZ47 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Tnnt3Q9QZ47 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Tnnt3Q9QZ47 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Tnnt3Q9QZ47 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Tnnt3Q9QZ47 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Tnnt3Q9QZ47 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Tnnt3Q9QZ47 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Tnnt3Q9QZ47 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Tnnt3Q9QZ47 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Tnnt3Q9QZ47 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Tnnt3Q9QZ47 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Tnnt3Q9QZ47 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Tnnt3Q9QZ47 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Tnnt3Q9QZ47 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Tnnt3Q9QZ47 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Tnnt3Q9QZ47 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Tnnt3Q9QZ47 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Tnnt3Q9QZ47 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Tnnt3Q9QZ47 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Tnnt3Q9QZ47 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Tnnt3Q9QZ47 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Tnnt3Q9QZ47 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Tnnt3Q9QZ47 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Tnnt3Q9QZ47 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Tnnt3Q9QZ47 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Tnnt3Q9QZ47 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Tnnt3Q9QZ47 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Tnnt3Q9QZ47 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Tnnt3Q9QZ47 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Tnnt3Q9QZ47 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.27
Tnnt3Q9QZ47 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Tnnt3Q9QZ47 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Tnnt3Q9QZ47 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Tnnt3Q9QZ47 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Tnnt3Q9QZ47 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Tnnt3Q9QZ47 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Tnnt3Q9QZ47 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Tnnt3Q9QZ47 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Tnnt3Q9QZ47 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Tnnt3Q9QZ47 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Tnnt3Q9QZ47 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Tnnt3Q9QZ47 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Tnnt3Q9QZ47 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Tnnt3Q9QZ47 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Tnnt3Q9QZ47 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Tnnt3Q9QZ47 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Tnnt3Q9QZ47 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Tnnt3Q9QZ47 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Tnnt3Q9QZ47 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Tnnt3Q9QZ47 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Tnnt3Q9QZ47 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Tnnt3Q9QZ47 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.6 ms