Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZ28

Six6, Homeobox protein SIX6, mousemouse

Predictions only

Length 246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Six6Q9QZ28 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Six6Q9QZ28 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Six6Q9QZ28 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Six6Q9QZ28 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Six6Q9QZ28 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Six6Q9QZ28 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Six6Q9QZ28 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Six6Q9QZ28 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Six6Q9QZ28 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Six6Q9QZ28 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Six6Q9QZ28 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Six6Q9QZ28 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Six6Q9QZ28 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Six6Q9QZ28 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Six6Q9QZ28 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Six6Q9QZ28 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Six6Q9QZ28 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Six6Q9QZ28 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Six6Q9QZ28 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Six6Q9QZ28 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Six6Q9QZ28 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Six6Q9QZ28 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Six6Q9QZ28 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Six6Q9QZ28 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Six6Q9QZ28 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Six6Q9QZ28 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Six6Q9QZ28 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Six6Q9QZ28 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Six6Q9QZ28 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Six6Q9QZ28 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Six6Q9QZ28 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Six6Q9QZ28 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Six6Q9QZ28 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Six6Q9QZ28 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Six6Q9QZ28 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Six6Q9QZ28 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Six6Q9QZ28 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Six6Q9QZ28 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Six6Q9QZ28 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Six6Q9QZ28 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Six6Q9QZ28 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Six6Q9QZ28 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Six6Q9QZ28 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Six6Q9QZ28 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Six6Q9QZ28 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Six6Q9QZ28 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Six6Q9QZ28 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Six6Q9QZ28 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Six6Q9QZ28 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Six6Q9QZ28 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Six6Q9QZ28 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Six6Q9QZ28 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Six6Q9QZ28 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Six6Q9QZ28 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Six6Q9QZ28 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Six6Q9QZ28 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Six6Q9QZ28 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Six6Q9QZ28 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Six6Q9QZ28 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Six6Q9QZ28 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Six6Q9QZ28 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Six6Q9QZ28 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Six6Q9QZ28 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Six6Q9QZ28 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Six6Q9QZ28 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Six6Q9QZ28 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Six6Q9QZ28 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Six6Q9QZ28 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Six6Q9QZ28 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Six6Q9QZ28 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Six6Q9QZ28 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Six6Q9QZ28 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Six6Q9QZ28 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Six6Q9QZ28 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Six6Q9QZ28 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Six6Q9QZ28 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Six6Q9QZ28 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Six6Q9QZ28 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Six6Q9QZ28 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Six6Q9QZ28 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Six6Q9QZ28 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Six6Q9QZ28 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Six6Q9QZ28 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Six6Q9QZ28 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Six6Q9QZ28 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Six6Q9QZ28 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Six6Q9QZ28 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Six6Q9QZ28 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Six6Q9QZ28 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Six6Q9QZ28 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Six6Q9QZ28 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Six6Q9QZ28 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Six6Q9QZ28 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Six6Q9QZ28 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Six6Q9QZ28 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Six6Q9QZ28 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Six6Q9QZ28 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Six6Q9QZ28 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Six6Q9QZ28 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Six6Q9QZ28 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.1 ms