Protein–RNA interactions for Protein: Q9QY61

Irx4, Iroquois-class homeodomain protein IRX-4, mousemouse

Predictions only

Length 515 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx4Q9QY61 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Irx4Q9QY61 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Irx4Q9QY61 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Irx4Q9QY61 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Irx4Q9QY61 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Irx4Q9QY61 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Irx4Q9QY61 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Irx4Q9QY61 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Irx4Q9QY61 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Irx4Q9QY61 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Irx4Q9QY61 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Irx4Q9QY61 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Irx4Q9QY61 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Irx4Q9QY61 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Irx4Q9QY61 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Irx4Q9QY61 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Irx4Q9QY61 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Irx4Q9QY61 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Irx4Q9QY61 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Irx4Q9QY61 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Irx4Q9QY61 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Irx4Q9QY61 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Irx4Q9QY61 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Irx4Q9QY61 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Irx4Q9QY61 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Irx4Q9QY61 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Irx4Q9QY61 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Irx4Q9QY61 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Irx4Q9QY61 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Irx4Q9QY61 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Irx4Q9QY61 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Irx4Q9QY61 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Irx4Q9QY61 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Irx4Q9QY61 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Irx4Q9QY61 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Irx4Q9QY61 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Irx4Q9QY61 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Irx4Q9QY61 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Irx4Q9QY61 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Irx4Q9QY61 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Irx4Q9QY61 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Irx4Q9QY61 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Irx4Q9QY61 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Irx4Q9QY61 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Irx4Q9QY61 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Irx4Q9QY61 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Irx4Q9QY61 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Irx4Q9QY61 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Irx4Q9QY61 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Irx4Q9QY61 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Irx4Q9QY61 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Irx4Q9QY61 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Irx4Q9QY61 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Irx4Q9QY61 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Irx4Q9QY61 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Irx4Q9QY61 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Irx4Q9QY61 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Irx4Q9QY61 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Irx4Q9QY61 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Irx4Q9QY61 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Irx4Q9QY61 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Irx4Q9QY61 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Irx4Q9QY61 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Irx4Q9QY61 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Irx4Q9QY61 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Irx4Q9QY61 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Irx4Q9QY61 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Irx4Q9QY61 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Irx4Q9QY61 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Irx4Q9QY61 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Irx4Q9QY61 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Irx4Q9QY61 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Irx4Q9QY61 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Irx4Q9QY61 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Irx4Q9QY61 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Irx4Q9QY61 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Irx4Q9QY61 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Irx4Q9QY61 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Irx4Q9QY61 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Irx4Q9QY61 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Irx4Q9QY61 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Irx4Q9QY61 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Irx4Q9QY61 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Irx4Q9QY61 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Irx4Q9QY61 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Irx4Q9QY61 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Irx4Q9QY61 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Irx4Q9QY61 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Irx4Q9QY61 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Irx4Q9QY61 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Irx4Q9QY61 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Irx4Q9QY61 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Irx4Q9QY61 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Irx4Q9QY61 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Irx4Q9QY61 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Irx4Q9QY61 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Irx4Q9QY61 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Irx4Q9QY61 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Irx4Q9QY61 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Irx4Q9QY61 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.4 ms