Protein–RNA interactions for Protein: Q9QY53

Nphp1, Nephrocystin-1, mousemouse

Predictions only

Length 687 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nphp1Q9QY53 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Nphp1Q9QY53 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Nphp1Q9QY53 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Nphp1Q9QY53 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Nphp1Q9QY53 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Nphp1Q9QY53 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Nphp1Q9QY53 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Nphp1Q9QY53 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Nphp1Q9QY53 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Nphp1Q9QY53 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Nphp1Q9QY53 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Nphp1Q9QY53 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Nphp1Q9QY53 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Nphp1Q9QY53 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Nphp1Q9QY53 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Nphp1Q9QY53 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Nphp1Q9QY53 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Nphp1Q9QY53 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Nphp1Q9QY53 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Nphp1Q9QY53 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Nphp1Q9QY53 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Nphp1Q9QY53 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Nphp1Q9QY53 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Nphp1Q9QY53 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Nphp1Q9QY53 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Nphp1Q9QY53 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Nphp1Q9QY53 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Nphp1Q9QY53 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Nphp1Q9QY53 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Nphp1Q9QY53 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Nphp1Q9QY53 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Nphp1Q9QY53 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Nphp1Q9QY53 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Nphp1Q9QY53 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Nphp1Q9QY53 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Nphp1Q9QY53 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Nphp1Q9QY53 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Nphp1Q9QY53 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Nphp1Q9QY53 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Nphp1Q9QY53 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Nphp1Q9QY53 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Nphp1Q9QY53 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
Nphp1Q9QY53 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Nphp1Q9QY53 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Nphp1Q9QY53 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Nphp1Q9QY53 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Nphp1Q9QY53 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Nphp1Q9QY53 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Nphp1Q9QY53 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Nphp1Q9QY53 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Nphp1Q9QY53 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Nphp1Q9QY53 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Nphp1Q9QY53 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Nphp1Q9QY53 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Nphp1Q9QY53 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Nphp1Q9QY53 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Nphp1Q9QY53 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Nphp1Q9QY53 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Nphp1Q9QY53 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Nphp1Q9QY53 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Nphp1Q9QY53 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Nphp1Q9QY53 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Nphp1Q9QY53 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Nphp1Q9QY53 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Nphp1Q9QY53 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Nphp1Q9QY53 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Nphp1Q9QY53 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Nphp1Q9QY53 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Nphp1Q9QY53 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Nphp1Q9QY53 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Nphp1Q9QY53 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Nphp1Q9QY53 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Nphp1Q9QY53 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Nphp1Q9QY53 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Nphp1Q9QY53 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Nphp1Q9QY53 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Nphp1Q9QY53 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Nphp1Q9QY53 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Nphp1Q9QY53 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Nphp1Q9QY53 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Nphp1Q9QY53 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Nphp1Q9QY53 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Nphp1Q9QY53 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Nphp1Q9QY53 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Nphp1Q9QY53 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Nphp1Q9QY53 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Nphp1Q9QY53 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Nphp1Q9QY53 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Nphp1Q9QY53 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Nphp1Q9QY53 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Nphp1Q9QY53 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Nphp1Q9QY53 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Nphp1Q9QY53 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Nphp1Q9QY53 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Nphp1Q9QY53 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Nphp1Q9QY53 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Nphp1Q9QY53 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Nphp1Q9QY53 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Nphp1Q9QY53 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Nphp1Q9QY53 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.8 ms