Protein–RNA interactions for Protein: Q9QY23

Pkp3, Plakophilin-3, mousemouse

Predictions only

Length 797 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkp3Q9QY23 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Pkp3Q9QY23 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Pkp3Q9QY23 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Pkp3Q9QY23 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Pkp3Q9QY23 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Pkp3Q9QY23 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Pkp3Q9QY23 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Pkp3Q9QY23 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Pkp3Q9QY23 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Pkp3Q9QY23 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Pkp3Q9QY23 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Pkp3Q9QY23 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Pkp3Q9QY23 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Pkp3Q9QY23 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Pkp3Q9QY23 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Pkp3Q9QY23 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Pkp3Q9QY23 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Pkp3Q9QY23 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Pkp3Q9QY23 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Pkp3Q9QY23 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Pkp3Q9QY23 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Pkp3Q9QY23 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Pkp3Q9QY23 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Pkp3Q9QY23 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Pkp3Q9QY23 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Pkp3Q9QY23 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Pkp3Q9QY23 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Pkp3Q9QY23 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Pkp3Q9QY23 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Pkp3Q9QY23 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Pkp3Q9QY23 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Pkp3Q9QY23 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Pkp3Q9QY23 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Pkp3Q9QY23 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Pkp3Q9QY23 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Pkp3Q9QY23 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Pkp3Q9QY23 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Pkp3Q9QY23 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Pkp3Q9QY23 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Pkp3Q9QY23 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Pkp3Q9QY23 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Pkp3Q9QY23 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Pkp3Q9QY23 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Pkp3Q9QY23 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Pkp3Q9QY23 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Pkp3Q9QY23 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Pkp3Q9QY23 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Pkp3Q9QY23 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Pkp3Q9QY23 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Pkp3Q9QY23 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Pkp3Q9QY23 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Pkp3Q9QY23 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Pkp3Q9QY23 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Pkp3Q9QY23 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Pkp3Q9QY23 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Pkp3Q9QY23 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Pkp3Q9QY23 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Pkp3Q9QY23 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Pkp3Q9QY23 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Pkp3Q9QY23 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Pkp3Q9QY23 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Pkp3Q9QY23 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Pkp3Q9QY23 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Pkp3Q9QY23 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Pkp3Q9QY23 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Pkp3Q9QY23 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Pkp3Q9QY23 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Pkp3Q9QY23 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Pkp3Q9QY23 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Pkp3Q9QY23 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Pkp3Q9QY23 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Pkp3Q9QY23 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Pkp3Q9QY23 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Pkp3Q9QY23 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Pkp3Q9QY23 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Pkp3Q9QY23 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Pkp3Q9QY23 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Pkp3Q9QY23 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Pkp3Q9QY23 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Pkp3Q9QY23 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Pkp3Q9QY23 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Pkp3Q9QY23 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Pkp3Q9QY23 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Pkp3Q9QY23 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Pkp3Q9QY23 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Pkp3Q9QY23 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Pkp3Q9QY23 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Pkp3Q9QY23 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Pkp3Q9QY23 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Pkp3Q9QY23 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Pkp3Q9QY23 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Pkp3Q9QY23 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Pkp3Q9QY23 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Pkp3Q9QY23 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Pkp3Q9QY23 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Pkp3Q9QY23 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Pkp3Q9QY23 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Pkp3Q9QY23 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Pkp3Q9QY23 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Pkp3Q9QY23 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.8 ms