Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXV1

Cbx8, Chromobox protein homolog 8, mousemouse

Predictions only

Length 362 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cbx8Q9QXV1 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cbx8Q9QXV1 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cbx8Q9QXV1 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cbx8Q9QXV1 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cbx8Q9QXV1 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cbx8Q9QXV1 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cbx8Q9QXV1 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cbx8Q9QXV1 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cbx8Q9QXV1 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cbx8Q9QXV1 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cbx8Q9QXV1 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cbx8Q9QXV1 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cbx8Q9QXV1 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cbx8Q9QXV1 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Cbx8Q9QXV1 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cbx8Q9QXV1 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cbx8Q9QXV1 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Cbx8Q9QXV1 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cbx8Q9QXV1 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cbx8Q9QXV1 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cbx8Q9QXV1 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cbx8Q9QXV1 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cbx8Q9QXV1 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cbx8Q9QXV1 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cbx8Q9QXV1 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cbx8Q9QXV1 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cbx8Q9QXV1 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cbx8Q9QXV1 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cbx8Q9QXV1 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cbx8Q9QXV1 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Cbx8Q9QXV1 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cbx8Q9QXV1 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cbx8Q9QXV1 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cbx8Q9QXV1 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cbx8Q9QXV1 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cbx8Q9QXV1 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cbx8Q9QXV1 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cbx8Q9QXV1 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cbx8Q9QXV1 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cbx8Q9QXV1 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cbx8Q9QXV1 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cbx8Q9QXV1 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cbx8Q9QXV1 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cbx8Q9QXV1 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cbx8Q9QXV1 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cbx8Q9QXV1 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cbx8Q9QXV1 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Cbx8Q9QXV1 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Cbx8Q9QXV1 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Cbx8Q9QXV1 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cbx8Q9QXV1 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cbx8Q9QXV1 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cbx8Q9QXV1 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Cbx8Q9QXV1 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cbx8Q9QXV1 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cbx8Q9QXV1 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cbx8Q9QXV1 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cbx8Q9QXV1 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cbx8Q9QXV1 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cbx8Q9QXV1 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cbx8Q9QXV1 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cbx8Q9QXV1 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Cbx8Q9QXV1 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Cbx8Q9QXV1 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Cbx8Q9QXV1 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Cbx8Q9QXV1 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Cbx8Q9QXV1 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Cbx8Q9QXV1 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Cbx8Q9QXV1 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Cbx8Q9QXV1 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Cbx8Q9QXV1 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Cbx8Q9QXV1 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Cbx8Q9QXV1 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Cbx8Q9QXV1 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Cbx8Q9QXV1 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Cbx8Q9QXV1 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Cbx8Q9QXV1 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Cbx8Q9QXV1 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Cbx8Q9QXV1 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cbx8Q9QXV1 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cbx8Q9QXV1 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cbx8Q9QXV1 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cbx8Q9QXV1 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cbx8Q9QXV1 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cbx8Q9QXV1 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cbx8Q9QXV1 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cbx8Q9QXV1 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cbx8Q9QXV1 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cbx8Q9QXV1 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cbx8Q9QXV1 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cbx8Q9QXV1 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cbx8Q9QXV1 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cbx8Q9QXV1 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cbx8Q9QXV1 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cbx8Q9QXV1 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cbx8Q9QXV1 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cbx8Q9QXV1 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cbx8Q9QXV1 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cbx8Q9QXV1 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cbx8Q9QXV1 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.3 ms