Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXJ1

Apbb1, Amyloid-beta A4 precursor protein-binding family B member 1, mousemouse

Predictions only

Length 710 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apbb1Q9QXJ1 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Apbb1Q9QXJ1 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Apbb1Q9QXJ1 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Apbb1Q9QXJ1 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Apbb1Q9QXJ1 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Apbb1Q9QXJ1 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Apbb1Q9QXJ1 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Apbb1Q9QXJ1 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Apbb1Q9QXJ1 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Apbb1Q9QXJ1 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Apbb1Q9QXJ1 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Apbb1Q9QXJ1 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Apbb1Q9QXJ1 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Apbb1Q9QXJ1 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Apbb1Q9QXJ1 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Apbb1Q9QXJ1 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Apbb1Q9QXJ1 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Apbb1Q9QXJ1 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Apbb1Q9QXJ1 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Apbb1Q9QXJ1 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Apbb1Q9QXJ1 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Apbb1Q9QXJ1 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Apbb1Q9QXJ1 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Apbb1Q9QXJ1 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Apbb1Q9QXJ1 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Apbb1Q9QXJ1 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Apbb1Q9QXJ1 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Apbb1Q9QXJ1 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Apbb1Q9QXJ1 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Apbb1Q9QXJ1 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Apbb1Q9QXJ1 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Apbb1Q9QXJ1 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Apbb1Q9QXJ1 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Apbb1Q9QXJ1 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Apbb1Q9QXJ1 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Apbb1Q9QXJ1 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Apbb1Q9QXJ1 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Apbb1Q9QXJ1 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Apbb1Q9QXJ1 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Apbb1Q9QXJ1 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Apbb1Q9QXJ1 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Apbb1Q9QXJ1 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Apbb1Q9QXJ1 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Apbb1Q9QXJ1 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Apbb1Q9QXJ1 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Apbb1Q9QXJ1 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Apbb1Q9QXJ1 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Apbb1Q9QXJ1 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Apbb1Q9QXJ1 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Apbb1Q9QXJ1 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Apbb1Q9QXJ1 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Apbb1Q9QXJ1 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Apbb1Q9QXJ1 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Apbb1Q9QXJ1 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Apbb1Q9QXJ1 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Apbb1Q9QXJ1 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Apbb1Q9QXJ1 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Apbb1Q9QXJ1 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Apbb1Q9QXJ1 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Apbb1Q9QXJ1 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Apbb1Q9QXJ1 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Apbb1Q9QXJ1 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Apbb1Q9QXJ1 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Apbb1Q9QXJ1 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Apbb1Q9QXJ1 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Apbb1Q9QXJ1 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Apbb1Q9QXJ1 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Apbb1Q9QXJ1 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Apbb1Q9QXJ1 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Apbb1Q9QXJ1 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Apbb1Q9QXJ1 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Apbb1Q9QXJ1 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Apbb1Q9QXJ1 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Apbb1Q9QXJ1 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Apbb1Q9QXJ1 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Apbb1Q9QXJ1 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Apbb1Q9QXJ1 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Apbb1Q9QXJ1 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Apbb1Q9QXJ1 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Apbb1Q9QXJ1 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Apbb1Q9QXJ1 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Apbb1Q9QXJ1 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Apbb1Q9QXJ1 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Apbb1Q9QXJ1 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Apbb1Q9QXJ1 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Apbb1Q9QXJ1 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Apbb1Q9QXJ1 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Apbb1Q9QXJ1 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Apbb1Q9QXJ1 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Apbb1Q9QXJ1 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Apbb1Q9QXJ1 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Apbb1Q9QXJ1 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Apbb1Q9QXJ1 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Apbb1Q9QXJ1 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Apbb1Q9QXJ1 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Apbb1Q9QXJ1 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Apbb1Q9QXJ1 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Apbb1Q9QXJ1 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Apbb1Q9QXJ1 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Apbb1Q9QXJ1 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.2 ms