Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXF8

Gnmt, Glycine N-methyltransferase, mousemouse

Predictions only

Length 293 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GnmtQ9QXF8 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GnmtQ9QXF8 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GnmtQ9QXF8 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GnmtQ9QXF8 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GnmtQ9QXF8 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GnmtQ9QXF8 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GnmtQ9QXF8 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GnmtQ9QXF8 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GnmtQ9QXF8 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GnmtQ9QXF8 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GnmtQ9QXF8 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GnmtQ9QXF8 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GnmtQ9QXF8 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GnmtQ9QXF8 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GnmtQ9QXF8 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GnmtQ9QXF8 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GnmtQ9QXF8 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GnmtQ9QXF8 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GnmtQ9QXF8 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GnmtQ9QXF8 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GnmtQ9QXF8 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GnmtQ9QXF8 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GnmtQ9QXF8 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
GnmtQ9QXF8 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GnmtQ9QXF8 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GnmtQ9QXF8 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GnmtQ9QXF8 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GnmtQ9QXF8 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GnmtQ9QXF8 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GnmtQ9QXF8 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GnmtQ9QXF8 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GnmtQ9QXF8 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GnmtQ9QXF8 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GnmtQ9QXF8 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GnmtQ9QXF8 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GnmtQ9QXF8 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GnmtQ9QXF8 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GnmtQ9QXF8 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GnmtQ9QXF8 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GnmtQ9QXF8 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GnmtQ9QXF8 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GnmtQ9QXF8 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GnmtQ9QXF8 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GnmtQ9QXF8 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GnmtQ9QXF8 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GnmtQ9QXF8 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GnmtQ9QXF8 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GnmtQ9QXF8 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GnmtQ9QXF8 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GnmtQ9QXF8 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GnmtQ9QXF8 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GnmtQ9QXF8 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GnmtQ9QXF8 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GnmtQ9QXF8 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GnmtQ9QXF8 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GnmtQ9QXF8 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GnmtQ9QXF8 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
GnmtQ9QXF8 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GnmtQ9QXF8 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GnmtQ9QXF8 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GnmtQ9QXF8 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GnmtQ9QXF8 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GnmtQ9QXF8 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GnmtQ9QXF8 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GnmtQ9QXF8 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GnmtQ9QXF8 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GnmtQ9QXF8 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GnmtQ9QXF8 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GnmtQ9QXF8 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GnmtQ9QXF8 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GnmtQ9QXF8 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GnmtQ9QXF8 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GnmtQ9QXF8 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GnmtQ9QXF8 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GnmtQ9QXF8 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GnmtQ9QXF8 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GnmtQ9QXF8 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GnmtQ9QXF8 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
GnmtQ9QXF8 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GnmtQ9QXF8 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GnmtQ9QXF8 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GnmtQ9QXF8 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
GnmtQ9QXF8 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GnmtQ9QXF8 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GnmtQ9QXF8 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GnmtQ9QXF8 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GnmtQ9QXF8 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
GnmtQ9QXF8 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GnmtQ9QXF8 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GnmtQ9QXF8 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GnmtQ9QXF8 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GnmtQ9QXF8 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GnmtQ9QXF8 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GnmtQ9QXF8 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GnmtQ9QXF8 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GnmtQ9QXF8 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GnmtQ9QXF8 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GnmtQ9QXF8 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GnmtQ9QXF8 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GnmtQ9QXF8 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.6 ms