Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXD8

Limd1, LIM domain-containing protein 1, mousemouse

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Length 668 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Limd1Q9QXD8 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Limd1Q9QXD8 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Limd1Q9QXD8 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Limd1Q9QXD8 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Limd1Q9QXD8 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Limd1Q9QXD8 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Limd1Q9QXD8 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Limd1Q9QXD8 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Limd1Q9QXD8 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Limd1Q9QXD8 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Limd1Q9QXD8 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Limd1Q9QXD8 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Limd1Q9QXD8 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Limd1Q9QXD8 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Limd1Q9QXD8 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Limd1Q9QXD8 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Limd1Q9QXD8 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Limd1Q9QXD8 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Limd1Q9QXD8 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Limd1Q9QXD8 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Limd1Q9QXD8 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Limd1Q9QXD8 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Limd1Q9QXD8 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Limd1Q9QXD8 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Limd1Q9QXD8 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Limd1Q9QXD8 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Limd1Q9QXD8 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Limd1Q9QXD8 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Limd1Q9QXD8 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Limd1Q9QXD8 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Limd1Q9QXD8 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Limd1Q9QXD8 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Limd1Q9QXD8 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Limd1Q9QXD8 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Limd1Q9QXD8 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Limd1Q9QXD8 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Limd1Q9QXD8 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Limd1Q9QXD8 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Limd1Q9QXD8 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Limd1Q9QXD8 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Limd1Q9QXD8 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Limd1Q9QXD8 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Limd1Q9QXD8 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Limd1Q9QXD8 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Limd1Q9QXD8 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Limd1Q9QXD8 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Limd1Q9QXD8 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Limd1Q9QXD8 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Limd1Q9QXD8 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Limd1Q9QXD8 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Limd1Q9QXD8 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Limd1Q9QXD8 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Limd1Q9QXD8 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Limd1Q9QXD8 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Limd1Q9QXD8 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Limd1Q9QXD8 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Limd1Q9QXD8 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Limd1Q9QXD8 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Limd1Q9QXD8 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Limd1Q9QXD8 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Limd1Q9QXD8 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Limd1Q9QXD8 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Limd1Q9QXD8 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Limd1Q9QXD8 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Limd1Q9QXD8 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Limd1Q9QXD8 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Limd1Q9QXD8 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Limd1Q9QXD8 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Limd1Q9QXD8 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Limd1Q9QXD8 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Limd1Q9QXD8 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Limd1Q9QXD8 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Limd1Q9QXD8 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Limd1Q9QXD8 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Limd1Q9QXD8 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Limd1Q9QXD8 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Limd1Q9QXD8 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Limd1Q9QXD8 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Limd1Q9QXD8 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Limd1Q9QXD8 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Limd1Q9QXD8 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Limd1Q9QXD8 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Limd1Q9QXD8 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Limd1Q9QXD8 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Limd1Q9QXD8 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Limd1Q9QXD8 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Limd1Q9QXD8 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Limd1Q9QXD8 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Limd1Q9QXD8 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Limd1Q9QXD8 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Limd1Q9QXD8 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Limd1Q9QXD8 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Limd1Q9QXD8 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Limd1Q9QXD8 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Limd1Q9QXD8 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Limd1Q9QXD8 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Limd1Q9QXD8 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Limd1Q9QXD8 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Limd1Q9QXD8 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Limd1Q9QXD8 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms