Protein–RNA interactions for Protein: Q9QX29

Trpc5, Short transient receptor potential channel 5, mousemouse

Predictions only

Length 975 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpc5Q9QX29 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Trpc5Q9QX29 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Trpc5Q9QX29 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Trpc5Q9QX29 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Trpc5Q9QX29 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Trpc5Q9QX29 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Trpc5Q9QX29 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Trpc5Q9QX29 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Trpc5Q9QX29 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Trpc5Q9QX29 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Trpc5Q9QX29 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Trpc5Q9QX29 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Trpc5Q9QX29 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Trpc5Q9QX29 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Trpc5Q9QX29 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Trpc5Q9QX29 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Trpc5Q9QX29 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Trpc5Q9QX29 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Trpc5Q9QX29 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Trpc5Q9QX29 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Trpc5Q9QX29 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Trpc5Q9QX29 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
Trpc5Q9QX29 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
Trpc5Q9QX29 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
Trpc5Q9QX29 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Trpc5Q9QX29 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Trpc5Q9QX29 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Trpc5Q9QX29 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Trpc5Q9QX29 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Trpc5Q9QX29 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Trpc5Q9QX29 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Trpc5Q9QX29 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Trpc5Q9QX29 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Trpc5Q9QX29 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Trpc5Q9QX29 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
Trpc5Q9QX29 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Trpc5Q9QX29 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Trpc5Q9QX29 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Trpc5Q9QX29 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Trpc5Q9QX29 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Trpc5Q9QX29 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Trpc5Q9QX29 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Trpc5Q9QX29 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Trpc5Q9QX29 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Trpc5Q9QX29 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Trpc5Q9QX29 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.95
Trpc5Q9QX29 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Trpc5Q9QX29 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Trpc5Q9QX29 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Trpc5Q9QX29 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Trpc5Q9QX29 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Trpc5Q9QX29 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Trpc5Q9QX29 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Trpc5Q9QX29 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
Trpc5Q9QX29 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Trpc5Q9QX29 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Trpc5Q9QX29 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
Trpc5Q9QX29 AC158982.1-201ENSMUST00000228377 901 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
Trpc5Q9QX29 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Trpc5Q9QX29 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Trpc5Q9QX29 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
Trpc5Q9QX29 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Trpc5Q9QX29 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Trpc5Q9QX29 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Trpc5Q9QX29 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Trpc5Q9QX29 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Trpc5Q9QX29 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Trpc5Q9QX29 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Trpc5Q9QX29 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC21■□□□□ 0.95
Trpc5Q9QX29 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
Trpc5Q9QX29 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Trpc5Q9QX29 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Trpc5Q9QX29 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
Trpc5Q9QX29 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Trpc5Q9QX29 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Trpc5Q9QX29 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
Trpc5Q9QX29 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Trpc5Q9QX29 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Trpc5Q9QX29 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Trpc5Q9QX29 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Trpc5Q9QX29 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Trpc5Q9QX29 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Trpc5Q9QX29 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Trpc5Q9QX29 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Trpc5Q9QX29 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
Trpc5Q9QX29 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Trpc5Q9QX29 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Trpc5Q9QX29 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Trpc5Q9QX29 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Trpc5Q9QX29 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Trpc5Q9QX29 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Trpc5Q9QX29 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Trpc5Q9QX29 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Trpc5Q9QX29 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Trpc5Q9QX29 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Trpc5Q9QX29 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
Trpc5Q9QX29 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Trpc5Q9QX29 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Trpc5Q9QX29 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Trpc5Q9QX29 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.3 ms