Protein–RNA interactions for Protein: Q9QVY8

Rai2, Retinoic acid-induced protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 529 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rai2Q9QVY8 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rai2Q9QVY8 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rai2Q9QVY8 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rai2Q9QVY8 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rai2Q9QVY8 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rai2Q9QVY8 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rai2Q9QVY8 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rai2Q9QVY8 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rai2Q9QVY8 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rai2Q9QVY8 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rai2Q9QVY8 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rai2Q9QVY8 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rai2Q9QVY8 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rai2Q9QVY8 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rai2Q9QVY8 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rai2Q9QVY8 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rai2Q9QVY8 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rai2Q9QVY8 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Rai2Q9QVY8 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Rai2Q9QVY8 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Rai2Q9QVY8 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Rai2Q9QVY8 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Rai2Q9QVY8 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rai2Q9QVY8 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rai2Q9QVY8 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rai2Q9QVY8 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rai2Q9QVY8 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rai2Q9QVY8 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Rai2Q9QVY8 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rai2Q9QVY8 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rai2Q9QVY8 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rai2Q9QVY8 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rai2Q9QVY8 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rai2Q9QVY8 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rai2Q9QVY8 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rai2Q9QVY8 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rai2Q9QVY8 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rai2Q9QVY8 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rai2Q9QVY8 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rai2Q9QVY8 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Rai2Q9QVY8 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rai2Q9QVY8 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rai2Q9QVY8 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rai2Q9QVY8 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Rai2Q9QVY8 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rai2Q9QVY8 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rai2Q9QVY8 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rai2Q9QVY8 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rai2Q9QVY8 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rai2Q9QVY8 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rai2Q9QVY8 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rai2Q9QVY8 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rai2Q9QVY8 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rai2Q9QVY8 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Rai2Q9QVY8 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rai2Q9QVY8 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rai2Q9QVY8 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Rai2Q9QVY8 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rai2Q9QVY8 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Rai2Q9QVY8 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rai2Q9QVY8 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rai2Q9QVY8 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rai2Q9QVY8 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rai2Q9QVY8 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rai2Q9QVY8 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rai2Q9QVY8 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rai2Q9QVY8 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rai2Q9QVY8 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rai2Q9QVY8 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rai2Q9QVY8 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rai2Q9QVY8 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rai2Q9QVY8 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rai2Q9QVY8 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rai2Q9QVY8 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rai2Q9QVY8 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rai2Q9QVY8 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rai2Q9QVY8 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rai2Q9QVY8 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rai2Q9QVY8 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rai2Q9QVY8 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rai2Q9QVY8 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rai2Q9QVY8 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rai2Q9QVY8 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rai2Q9QVY8 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rai2Q9QVY8 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rai2Q9QVY8 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rai2Q9QVY8 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rai2Q9QVY8 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rai2Q9QVY8 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rai2Q9QVY8 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rai2Q9QVY8 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rai2Q9QVY8 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rai2Q9QVY8 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rai2Q9QVY8 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rai2Q9QVY8 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rai2Q9QVY8 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rai2Q9QVY8 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rai2Q9QVY8 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rai2Q9QVY8 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rai2Q9QVY8 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms