Protein–RNA interactions for Protein: Q9QUN9

Dkk3, Dickkopf-related protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 349 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dkk3Q9QUN9 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Dkk3Q9QUN9 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Dkk3Q9QUN9 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Dkk3Q9QUN9 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Dkk3Q9QUN9 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Dkk3Q9QUN9 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Dkk3Q9QUN9 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Dkk3Q9QUN9 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Dkk3Q9QUN9 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Dkk3Q9QUN9 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Dkk3Q9QUN9 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Dkk3Q9QUN9 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Dkk3Q9QUN9 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Dkk3Q9QUN9 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Dkk3Q9QUN9 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Dkk3Q9QUN9 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Dkk3Q9QUN9 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Dkk3Q9QUN9 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Dkk3Q9QUN9 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Dkk3Q9QUN9 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Dkk3Q9QUN9 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Dkk3Q9QUN9 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Dkk3Q9QUN9 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Dkk3Q9QUN9 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Dkk3Q9QUN9 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Dkk3Q9QUN9 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Dkk3Q9QUN9 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Dkk3Q9QUN9 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Dkk3Q9QUN9 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Dkk3Q9QUN9 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Dkk3Q9QUN9 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Dkk3Q9QUN9 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Dkk3Q9QUN9 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Dkk3Q9QUN9 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Dkk3Q9QUN9 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Dkk3Q9QUN9 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Dkk3Q9QUN9 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Dkk3Q9QUN9 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Dkk3Q9QUN9 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Dkk3Q9QUN9 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Dkk3Q9QUN9 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Dkk3Q9QUN9 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Dkk3Q9QUN9 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Dkk3Q9QUN9 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Dkk3Q9QUN9 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Dkk3Q9QUN9 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Dkk3Q9QUN9 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Dkk3Q9QUN9 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Dkk3Q9QUN9 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Dkk3Q9QUN9 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Dkk3Q9QUN9 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Dkk3Q9QUN9 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Dkk3Q9QUN9 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Dkk3Q9QUN9 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Dkk3Q9QUN9 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Dkk3Q9QUN9 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Dkk3Q9QUN9 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Dkk3Q9QUN9 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Dkk3Q9QUN9 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Dkk3Q9QUN9 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Dkk3Q9QUN9 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Dkk3Q9QUN9 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Dkk3Q9QUN9 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Dkk3Q9QUN9 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Dkk3Q9QUN9 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Dkk3Q9QUN9 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Dkk3Q9QUN9 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Dkk3Q9QUN9 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Dkk3Q9QUN9 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Dkk3Q9QUN9 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Dkk3Q9QUN9 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Dkk3Q9QUN9 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Dkk3Q9QUN9 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Dkk3Q9QUN9 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Dkk3Q9QUN9 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Dkk3Q9QUN9 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Dkk3Q9QUN9 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Dkk3Q9QUN9 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Dkk3Q9QUN9 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Dkk3Q9QUN9 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Dkk3Q9QUN9 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Dkk3Q9QUN9 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Dkk3Q9QUN9 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Dkk3Q9QUN9 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Dkk3Q9QUN9 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Dkk3Q9QUN9 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Dkk3Q9QUN9 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Dkk3Q9QUN9 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Dkk3Q9QUN9 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Dkk3Q9QUN9 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Dkk3Q9QUN9 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Dkk3Q9QUN9 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Dkk3Q9QUN9 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Dkk3Q9QUN9 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Dkk3Q9QUN9 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Dkk3Q9QUN9 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Dkk3Q9QUN9 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Dkk3Q9QUN9 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Dkk3Q9QUN9 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Dkk3Q9QUN9 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.2 ms