Protein–RNA interactions for Protein: Q9QUK0

Cdkl2, Cyclin-dependent kinase-like 2, mousemouse

Predictions only

Length 568 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdkl2Q9QUK0 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cdkl2Q9QUK0 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cdkl2Q9QUK0 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cdkl2Q9QUK0 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cdkl2Q9QUK0 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cdkl2Q9QUK0 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cdkl2Q9QUK0 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cdkl2Q9QUK0 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cdkl2Q9QUK0 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cdkl2Q9QUK0 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cdkl2Q9QUK0 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cdkl2Q9QUK0 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cdkl2Q9QUK0 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cdkl2Q9QUK0 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cdkl2Q9QUK0 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cdkl2Q9QUK0 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cdkl2Q9QUK0 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Cdkl2Q9QUK0 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cdkl2Q9QUK0 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cdkl2Q9QUK0 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cdkl2Q9QUK0 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cdkl2Q9QUK0 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cdkl2Q9QUK0 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cdkl2Q9QUK0 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cdkl2Q9QUK0 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cdkl2Q9QUK0 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cdkl2Q9QUK0 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Cdkl2Q9QUK0 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cdkl2Q9QUK0 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Cdkl2Q9QUK0 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cdkl2Q9QUK0 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cdkl2Q9QUK0 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cdkl2Q9QUK0 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cdkl2Q9QUK0 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cdkl2Q9QUK0 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cdkl2Q9QUK0 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cdkl2Q9QUK0 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Cdkl2Q9QUK0 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cdkl2Q9QUK0 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cdkl2Q9QUK0 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cdkl2Q9QUK0 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cdkl2Q9QUK0 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cdkl2Q9QUK0 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Cdkl2Q9QUK0 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cdkl2Q9QUK0 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cdkl2Q9QUK0 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cdkl2Q9QUK0 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cdkl2Q9QUK0 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cdkl2Q9QUK0 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cdkl2Q9QUK0 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cdkl2Q9QUK0 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cdkl2Q9QUK0 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Cdkl2Q9QUK0 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cdkl2Q9QUK0 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cdkl2Q9QUK0 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cdkl2Q9QUK0 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Cdkl2Q9QUK0 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Cdkl2Q9QUK0 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Cdkl2Q9QUK0 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cdkl2Q9QUK0 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cdkl2Q9QUK0 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Cdkl2Q9QUK0 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cdkl2Q9QUK0 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cdkl2Q9QUK0 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cdkl2Q9QUK0 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cdkl2Q9QUK0 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cdkl2Q9QUK0 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cdkl2Q9QUK0 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cdkl2Q9QUK0 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cdkl2Q9QUK0 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cdkl2Q9QUK0 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cdkl2Q9QUK0 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cdkl2Q9QUK0 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cdkl2Q9QUK0 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cdkl2Q9QUK0 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cdkl2Q9QUK0 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cdkl2Q9QUK0 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Cdkl2Q9QUK0 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cdkl2Q9QUK0 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cdkl2Q9QUK0 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cdkl2Q9QUK0 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cdkl2Q9QUK0 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cdkl2Q9QUK0 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cdkl2Q9QUK0 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cdkl2Q9QUK0 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cdkl2Q9QUK0 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cdkl2Q9QUK0 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cdkl2Q9QUK0 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cdkl2Q9QUK0 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cdkl2Q9QUK0 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cdkl2Q9QUK0 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cdkl2Q9QUK0 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cdkl2Q9QUK0 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cdkl2Q9QUK0 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cdkl2Q9QUK0 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cdkl2Q9QUK0 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cdkl2Q9QUK0 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cdkl2Q9QUK0 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cdkl2Q9QUK0 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cdkl2Q9QUK0 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.3 ms