Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLF7

Tlr5, Toll-like receptor 5, mousemouse

Predictions only

Length 859 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tlr5Q9JLF7 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Tlr5Q9JLF7 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Tlr5Q9JLF7 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Tlr5Q9JLF7 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Tlr5Q9JLF7 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Tlr5Q9JLF7 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Tlr5Q9JLF7 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Tlr5Q9JLF7 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Tlr5Q9JLF7 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Tlr5Q9JLF7 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Tlr5Q9JLF7 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Tlr5Q9JLF7 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Tlr5Q9JLF7 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Tlr5Q9JLF7 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Tlr5Q9JLF7 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Tlr5Q9JLF7 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Tlr5Q9JLF7 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Tlr5Q9JLF7 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Tlr5Q9JLF7 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Tlr5Q9JLF7 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Tlr5Q9JLF7 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Tlr5Q9JLF7 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Tlr5Q9JLF7 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Tlr5Q9JLF7 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Tlr5Q9JLF7 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Tlr5Q9JLF7 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Tlr5Q9JLF7 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Tlr5Q9JLF7 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Tlr5Q9JLF7 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Tlr5Q9JLF7 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Tlr5Q9JLF7 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Tlr5Q9JLF7 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Tlr5Q9JLF7 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC18.58■□□□□ 0.57
Tlr5Q9JLF7 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Tlr5Q9JLF7 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Tlr5Q9JLF7 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Tlr5Q9JLF7 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Tlr5Q9JLF7 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Tlr5Q9JLF7 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Tlr5Q9JLF7 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Tlr5Q9JLF7 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Tlr5Q9JLF7 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Tlr5Q9JLF7 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Tlr5Q9JLF7 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Tlr5Q9JLF7 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Tlr5Q9JLF7 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Tlr5Q9JLF7 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Tlr5Q9JLF7 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Tlr5Q9JLF7 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tlr5Q9JLF7 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tlr5Q9JLF7 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tlr5Q9JLF7 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tlr5Q9JLF7 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tlr5Q9JLF7 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tlr5Q9JLF7 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tlr5Q9JLF7 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tlr5Q9JLF7 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tlr5Q9JLF7 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tlr5Q9JLF7 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tlr5Q9JLF7 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Tlr5Q9JLF7 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Tlr5Q9JLF7 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tlr5Q9JLF7 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tlr5Q9JLF7 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tlr5Q9JLF7 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tlr5Q9JLF7 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tlr5Q9JLF7 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tlr5Q9JLF7 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Tlr5Q9JLF7 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tlr5Q9JLF7 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Tlr5Q9JLF7 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Tlr5Q9JLF7 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Tlr5Q9JLF7 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Tlr5Q9JLF7 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Tlr5Q9JLF7 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Tlr5Q9JLF7 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Tlr5Q9JLF7 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Tlr5Q9JLF7 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Tlr5Q9JLF7 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Tlr5Q9JLF7 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Tlr5Q9JLF7 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Tlr5Q9JLF7 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Tlr5Q9JLF7 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Tlr5Q9JLF7 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tlr5Q9JLF7 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tlr5Q9JLF7 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tlr5Q9JLF7 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tlr5Q9JLF7 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Tlr5Q9JLF7 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tlr5Q9JLF7 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tlr5Q9JLF7 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Tlr5Q9JLF7 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tlr5Q9JLF7 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tlr5Q9JLF7 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tlr5Q9JLF7 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tlr5Q9JLF7 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tlr5Q9JLF7 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tlr5Q9JLF7 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tlr5Q9JLF7 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tlr5Q9JLF7 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
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