Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLC8

Sacs, Sacsin, mousemouse

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Length 4,582 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SacsQ9JLC8 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
SacsQ9JLC8 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
SacsQ9JLC8 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
SacsQ9JLC8 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
SacsQ9JLC8 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
SacsQ9JLC8 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
SacsQ9JLC8 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
SacsQ9JLC8 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
SacsQ9JLC8 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
SacsQ9JLC8 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
SacsQ9JLC8 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
SacsQ9JLC8 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
SacsQ9JLC8 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
SacsQ9JLC8 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
SacsQ9JLC8 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
SacsQ9JLC8 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
SacsQ9JLC8 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
SacsQ9JLC8 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
SacsQ9JLC8 Mafg-203ENSMUST00000106181 840 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.73□□□□□ -0.69
SacsQ9JLC8 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
SacsQ9JLC8 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
SacsQ9JLC8 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
SacsQ9JLC8 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
SacsQ9JLC8 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
SacsQ9JLC8 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
SacsQ9JLC8 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
SacsQ9JLC8 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
SacsQ9JLC8 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
SacsQ9JLC8 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
SacsQ9JLC8 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
SacsQ9JLC8 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC10.72□□□□□ -0.69
SacsQ9JLC8 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
SacsQ9JLC8 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
SacsQ9JLC8 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
SacsQ9JLC8 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
SacsQ9JLC8 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
SacsQ9JLC8 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
SacsQ9JLC8 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
SacsQ9JLC8 AC140375.2-201ENSMUST00000225283 584 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
SacsQ9JLC8 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
SacsQ9JLC8 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC10.72□□□□□ -0.69
SacsQ9JLC8 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
SacsQ9JLC8 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
SacsQ9JLC8 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC10.72□□□□□ -0.69
SacsQ9JLC8 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC10.72□□□□□ -0.69
SacsQ9JLC8 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
SacsQ9JLC8 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
SacsQ9JLC8 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
SacsQ9JLC8 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
SacsQ9JLC8 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
SacsQ9JLC8 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
SacsQ9JLC8 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
SacsQ9JLC8 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
SacsQ9JLC8 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
SacsQ9JLC8 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
SacsQ9JLC8 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
SacsQ9JLC8 Gm31105-201ENSMUST00000211421 687 ntTSL 2 BASIC10.71□□□□□ -0.69
SacsQ9JLC8 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
SacsQ9JLC8 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
SacsQ9JLC8 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
SacsQ9JLC8 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
SacsQ9JLC8 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
SacsQ9JLC8 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
SacsQ9JLC8 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
SacsQ9JLC8 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
SacsQ9JLC8 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC10.71□□□□□ -0.7
SacsQ9JLC8 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
SacsQ9JLC8 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
SacsQ9JLC8 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.7
SacsQ9JLC8 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
SacsQ9JLC8 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
SacsQ9JLC8 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
SacsQ9JLC8 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
SacsQ9JLC8 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
SacsQ9JLC8 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
SacsQ9JLC8 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
SacsQ9JLC8 Dusp13-202ENSMUST00000119866 1342 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.7
SacsQ9JLC8 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
SacsQ9JLC8 Vamp2-202ENSMUST00000117780 1113 ntTSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
SacsQ9JLC8 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
SacsQ9JLC8 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
SacsQ9JLC8 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
SacsQ9JLC8 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
SacsQ9JLC8 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
SacsQ9JLC8 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
SacsQ9JLC8 Kir3dl1-201ENSMUST00000113104 1031 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
SacsQ9JLC8 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
SacsQ9JLC8 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
SacsQ9JLC8 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
SacsQ9JLC8 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
SacsQ9JLC8 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
SacsQ9JLC8 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
SacsQ9JLC8 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
SacsQ9JLC8 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
SacsQ9JLC8 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
SacsQ9JLC8 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
SacsQ9JLC8 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC10.69□□□□□ -0.7
SacsQ9JLC8 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
SacsQ9JLC8 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
SacsQ9JLC8 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
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