Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLC6

Tef, Thyrotroph embryonic factor, mousemouse

Predictions only

Length 301 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TefQ9JLC6 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TefQ9JLC6 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TefQ9JLC6 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TefQ9JLC6 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TefQ9JLC6 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TefQ9JLC6 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TefQ9JLC6 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TefQ9JLC6 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TefQ9JLC6 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
TefQ9JLC6 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.07
TefQ9JLC6 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
TefQ9JLC6 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
TefQ9JLC6 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TefQ9JLC6 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TefQ9JLC6 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
TefQ9JLC6 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
TefQ9JLC6 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
TefQ9JLC6 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TefQ9JLC6 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TefQ9JLC6 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TefQ9JLC6 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TefQ9JLC6 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TefQ9JLC6 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
TefQ9JLC6 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TefQ9JLC6 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TefQ9JLC6 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TefQ9JLC6 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TefQ9JLC6 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TefQ9JLC6 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TefQ9JLC6 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
TefQ9JLC6 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
TefQ9JLC6 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
TefQ9JLC6 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
TefQ9JLC6 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
TefQ9JLC6 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TefQ9JLC6 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TefQ9JLC6 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TefQ9JLC6 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TefQ9JLC6 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TefQ9JLC6 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TefQ9JLC6 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TefQ9JLC6 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TefQ9JLC6 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
TefQ9JLC6 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TefQ9JLC6 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TefQ9JLC6 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TefQ9JLC6 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
TefQ9JLC6 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TefQ9JLC6 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
TefQ9JLC6 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
TefQ9JLC6 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
TefQ9JLC6 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TefQ9JLC6 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
TefQ9JLC6 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
TefQ9JLC6 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
TefQ9JLC6 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
TefQ9JLC6 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TefQ9JLC6 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TefQ9JLC6 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TefQ9JLC6 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TefQ9JLC6 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
TefQ9JLC6 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TefQ9JLC6 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TefQ9JLC6 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
TefQ9JLC6 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
TefQ9JLC6 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
TefQ9JLC6 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TefQ9JLC6 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
TefQ9JLC6 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TefQ9JLC6 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TefQ9JLC6 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
TefQ9JLC6 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TefQ9JLC6 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TefQ9JLC6 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
TefQ9JLC6 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TefQ9JLC6 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TefQ9JLC6 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TefQ9JLC6 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TefQ9JLC6 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TefQ9JLC6 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TefQ9JLC6 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TefQ9JLC6 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TefQ9JLC6 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TefQ9JLC6 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
TefQ9JLC6 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TefQ9JLC6 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TefQ9JLC6 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TefQ9JLC6 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TefQ9JLC6 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TefQ9JLC6 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TefQ9JLC6 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TefQ9JLC6 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TefQ9JLC6 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TefQ9JLC6 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
TefQ9JLC6 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.07
TefQ9JLC6 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TefQ9JLC6 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TefQ9JLC6 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
TefQ9JLC6 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
TefQ9JLC6 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.1 ms