Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKY0

Cnot9, CCR4-NOT transcription complex subunit 9, mousemouse

Predictions only

Length 299 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnot9Q9JKY0 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cnot9Q9JKY0 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cnot9Q9JKY0 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Cnot9Q9JKY0 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cnot9Q9JKY0 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cnot9Q9JKY0 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cnot9Q9JKY0 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cnot9Q9JKY0 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cnot9Q9JKY0 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cnot9Q9JKY0 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cnot9Q9JKY0 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cnot9Q9JKY0 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cnot9Q9JKY0 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cnot9Q9JKY0 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cnot9Q9JKY0 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cnot9Q9JKY0 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cnot9Q9JKY0 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cnot9Q9JKY0 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cnot9Q9JKY0 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cnot9Q9JKY0 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cnot9Q9JKY0 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cnot9Q9JKY0 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cnot9Q9JKY0 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cnot9Q9JKY0 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cnot9Q9JKY0 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cnot9Q9JKY0 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cnot9Q9JKY0 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cnot9Q9JKY0 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cnot9Q9JKY0 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cnot9Q9JKY0 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cnot9Q9JKY0 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cnot9Q9JKY0 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cnot9Q9JKY0 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cnot9Q9JKY0 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cnot9Q9JKY0 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cnot9Q9JKY0 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cnot9Q9JKY0 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cnot9Q9JKY0 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Cnot9Q9JKY0 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cnot9Q9JKY0 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cnot9Q9JKY0 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cnot9Q9JKY0 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cnot9Q9JKY0 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cnot9Q9JKY0 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cnot9Q9JKY0 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cnot9Q9JKY0 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cnot9Q9JKY0 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cnot9Q9JKY0 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cnot9Q9JKY0 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cnot9Q9JKY0 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cnot9Q9JKY0 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cnot9Q9JKY0 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cnot9Q9JKY0 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cnot9Q9JKY0 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.14
Cnot9Q9JKY0 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.14
Cnot9Q9JKY0 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cnot9Q9JKY0 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cnot9Q9JKY0 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cnot9Q9JKY0 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cnot9Q9JKY0 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cnot9Q9JKY0 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cnot9Q9JKY0 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cnot9Q9JKY0 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cnot9Q9JKY0 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Cnot9Q9JKY0 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cnot9Q9JKY0 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cnot9Q9JKY0 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cnot9Q9JKY0 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Cnot9Q9JKY0 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Cnot9Q9JKY0 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cnot9Q9JKY0 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cnot9Q9JKY0 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cnot9Q9JKY0 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cnot9Q9JKY0 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Cnot9Q9JKY0 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cnot9Q9JKY0 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cnot9Q9JKY0 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cnot9Q9JKY0 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cnot9Q9JKY0 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cnot9Q9JKY0 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cnot9Q9JKY0 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Cnot9Q9JKY0 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cnot9Q9JKY0 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cnot9Q9JKY0 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cnot9Q9JKY0 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cnot9Q9JKY0 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cnot9Q9JKY0 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cnot9Q9JKY0 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cnot9Q9JKY0 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cnot9Q9JKY0 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cnot9Q9JKY0 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cnot9Q9JKY0 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cnot9Q9JKY0 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cnot9Q9JKY0 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cnot9Q9JKY0 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cnot9Q9JKY0 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cnot9Q9JKY0 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cnot9Q9JKY0 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cnot9Q9JKY0 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Cnot9Q9JKY0 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.9 ms